REPCCOAI

Type	Série de campagnes océanographiques
Dates	01/01/2017 - 15/02/2020
Chef(s) de mission	KOUBBI Philippe
Chef de projet	KOUBBI Philippe
DOI	10.18142/249
Objectif	Nous avons effectué des prélèvements annuels en janvier-février à bord du R/V "Marion Dufresne" depuis 2013 pour le mésozooplancton et 2017 pour le macrozooplancton et les poissons. Ces relevés ont eu lieu en conjonction avec le programme d'observation "South Indian Ocean Observation" (OISO PI : Claire Lo Monaco) (https://caraus.ipsl.jussieu.fr/oiso-accueil.html) et THEMISTO (PI : Cédric Cotté) sur l'utilisation de l'acoustique pour déterminer les abondances de poissons et de plancton. Les prélèvements REPCCOAI ont eu lieu en janvier et février de 2017 à 2019. Les prélèvements du programmes MDCPR ont été effectués de 2013 à 2016. La zone d'étude est située dans l'océan Indien subtropical et l'océan Austral. Le réseau d'échantillonnage passe par les archipels de Crozet et de Kerguelen dans l'océan Austral et se termine à proximité des îles de Saint-Paul et de la Nouvelle Amsterdam dans la partie sud de l'océan Indien. Ces missions traversent plusieurs provinces océanographiques et biogéochimiques allant des eaux tropicales de l'océan Indien aux eaux froides de l'océan Austral sachant que la zone d'étude est séparée par différents fronts hydrologiques identifiables par leurs caractéristiques physiques et chimiques. Le mésozooplancton a été collecté (1) en subsurface en continu entre les stations OISO grâce au Continuous Plankton Recorder et (2) à chaque station, en vertical, avec un WP2 (200 µm) (en 2018 et 2019). Le macrozooplancton tels que les euphausiacés et les poissons mésopélagiques ont été échantillonnés à chaque station avec un chalut pélagique Isaacs-Kidd (IKMT). Le filet IKMT possède une aile métallique qui maintient le filet ouvert. Le filet a une longueur totale de 17 m avec un maillage décroissant allant de 4 cm à l'entrée à 0,5 cm avant le collecteur. L'IKMT a été déployé depuis la surface jusqu'à différentes profondeurs, principalement 200 m, 600 m ou 1000-1200 m. Le filet est remorqué à une vitesse du navire comprise entre deux et trois n?uds. Les poissons et le plancton sont traités en laboratoire afin d'étudier leur distribution et de cartographier les patterns de diversité. Au delà des prélèvements réalisés dans le cadre de l'étude de la diversité du krill (échantillonnage en vue du séquençage des transcriptomes), les espèces d'euphausiacés pêchés avec le filet IKMT en quantité suffisante (E. vallentini et E. triacantha) et dans un état compatible avec une expérimentation in vivo ont été maintenus en stabulation en chambre froide environ 24h avant la mise en oeuvre d'un choc thermique en aquarium (CT50) selon le protocole formalisé (voir Cascella et al, 2015) sur les autres espèces déjà expérimentées.

Bibliographie

Publications

Izard L., Fonvieille N., Merland C., Koubbi P., Nerini D., Habasque Jeremie, Lebourges-Dhaussy Anne, Lo Monaco C., Roudaut Gildas, D’ovidio F., Charrassin J.-B., Cotté Cedric (2024). Decomposing acoustic signal reveals the pelagic response to a frontal system between oceanic domains. Journal Of Marine Systems, 243, 103951 (19p.). https://doi.org/10.1016/j.jmarsys.2023.103951

Godet Claire, Robuchon Marine, Leroy Boris, Cotté Cedric, Baudena Alberto, Da Silva Ophélie, Fabri-Ruiz Salome , Lo Monaco Claire, Sergi Sara, Koubbi Philippe (2020). Matching zooplankton abundance and environment in the South Indian Ocean and Southern Ocean. Deep-sea Research Part I-oceanographic Research Papers, 163, 103347 (12p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.dsr.2020.103347 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00643/75474/

Gallet Alison, Koubbi Philippe, Léger Nelly, Scheifler Mathilde, Ruiz-Rodriguez Magdalena, Suzuki Marcelino T., Desdevises Yves, Duperron Sebastien (2019). Low-diversity bacterial microbiota in Southern Ocean representatives of lanternfish genera Electrona, Protomyctophum and Gymnoscopelus (family Myctophidae). Plos One, 14(12), e0226159 (17p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.1371/journal.pone.0226159 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00598/70973/

Batten Sonia D., Abu-Alhaija Rana, Chiba Sanae, Edwards Martin, Grahams George, Jyothibabu R., Kitchener John A., Koubbis Philippe, McQuatters-Gollop Abigail, Muxagata Erik, Ostle Clare, Richardson Anthony J., Robinson Karen, V, Takahashi Kunio T., Verheye Hans M., Wilson Willie (2019). A Global Plankton Diversity Monitoring Program. Frontiers In Marine Science, 6(321), 14p.-. Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmars.2019.00321 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00689/80060/

Meilland Julie, Fabri-Ruiz Salome , Koubbi Philippe, Lo Monaco Claire, Cotte Cedric, Hosie Graham W., Sanchez Sophie, Howa Helene (2016). Planktonic foraminiferal biogeography in the Indian sector of the Southern Ocean: Contribution from CPR data. Deep-sea Research Part I-oceanographic Research Papers, 110, 75-89. https://doi.org/10.1016/j.dsr.2015.12.014

Références des publications parues dans d'autres revues ou des ouvrages scientifiques faisant référence dans la discipline

Meilland Julie, Howa Hélène, Koubbi Philippe (2015). Biogeography of Foraminifera in the Southwestern Indian Ocean. GACS Newsletter, (7), 7.

Références des rapports techniques

Makhado, A.B., Lowther, A., Koubbi, P., Ansorge, I., Brooks, C., Cotté, C., Crawford, R., Dlulisa, S., d'Ovidio, F., Fawcet, S., Freeman, D., Grant, S., Huggett, J., Hindell, M., Hulley, P.A., Kirkman, S., Lamont, T., Lombard, M., Masothla, M.J., Lea, M.-A., Oosthuizen, W.C., Orgeret, F., Reisinger, R., Samaai, T., Sergi, S., Swadling, K., Somhlaba, S., Van de Putte, A., Von de Meden, C., Yemane, D., 2019. Expert Workshop on Pelagic Spatial Planning for the eastern subantarctic region (Domains 4, 5 and 6). SC-CAMLR-38/BG/29.

MDCPR VT126, VT137 et VT143 : Koubbi, P., Guinet, C., Alloncle, N., Ameziane, N., Azam, C.S., Baudena, A., Bost, C.A., Causse, R., Chazeau, C., Coste, G., Cotté, C., D'Ovidio, F., Delord, K., Duhamel, G., Forget, A., Gasco, N., Hautec?ur, M., Lehodey, P., Lo Monaco, C., Marteau, C., Martin, A., Mignard, C., Pruvost, P., Saucède, T., Sinegre, R., Thellier, T., Verdier, A.G., Weimerskirch, H., 2016a. Ecoregionalisation of the Kerguelen and Crozet islands oceanic zone. Part I: Introduction and Kerguelen oceanic zone, CCAMLR WG-EMM-16/43.

MDCPR VT126, VT137 et VT143 : Koubbi, P., Mignard, C., Causse, R., Da Silva, O., Baudena, A., Bost, C., Cotté, C., d'Ovidio, F., Della Penna, A., Delord, K., Fabri-?Ruiz, S., Ferrieux, M., Guinet, C., Lo Monaco, C., Saucède, T., Weimerskirch, H., 2016b. Ecoregionalisation of the Kerguelen and Crozet islands oceanic zone. Part II: The Crozet oceanic zone, CCAMLR WG-EMM-16/54.

Références des articles parus dans des revues ou des journaux à grand public

Koubbi P. (2019). Compte tweeter @Ocean_biodiv. Communication sur la biodiversité et la mission de 2019.

MDCPR VT126 : Meilland, J., Howa, H., Koubbi, P., 2015. Biogeography of Foraminifera in the Southwestern Indian Ocean. SAHFOS Eds, GACS newsletter n°7, 7, April 2015.

Références des communications dans des colloques internationaux

Batten, S.D., Abu-Alhaija, R., Chiba, S., Edwards, M., Graham, G., Jyothibabu, R., Kitchener, J.A., Koubbi, P., McQuatters-Gollop, A., Muxagata, E., Ostle, C., Richardson, A.J., Robinson, K.V., Takahashi, K.T., Verheye, H.M., Wilson, W., 2019. A Global Plankton Diversity Monitoring Program. Ocean Obs19.

Syuan-Huai Shi, Kuo-Hsun Chiu, Jean-Yves Toullec, Chi-Ying LeeMetabolic basis underlying temperature adaptation of Euphausia: metabolic profiling and comparison of two geographically differently located euphausiids (E. superba and E. triacantha) using lipidomics and metabolomics analyses, 2019. Changua (Taïwan)

MDCPR VT126, VT137 et VT143 : Koubbi, P., Mignard, C., Causse, R., Da Silva, O., Baudena, A., Bost, C., Cotté, C., d'Ovidio, F., Della Penna, A., Delord, K., Fabri-Ruiz, S., Ferrieux, M., Guinet, C., Le Roy, B., Lo Monaco, C., Robuchon, M., Saucède, T., Weimerskirch, H., 2016. Crozet Marine Ecosystem Based Management. SCAR Open Science Conference. Kuala Lumpur.

MDCPR VT126 : Howa, H., Meilland, J., Fabri-Ruiz, S., Sanchez, S., Lo Monaco, C., Cotte, C., Hosie, G., Koubbi, P., 2015. Planktonic foraminifera distribution in the Indian sector of the Southern Ocean from CPR investigations. The Micropalaeontological Society "Foraminifera and Calcareous Nannofossil Groups", Spring Meeting, June 2015, Plymouth, UK.

Références des communications dans des colloques nationaux

Duperron, S., Gallet, A., Léger, N., Sheifler, M., Ruiz-Rodriguez, M., Suzuki, M., Desdevisse, Y., Koubbi, P., 2019. Premières nouvelles du microbiote des poissons lanternes de l'océan Austral (Myctophidae). AEFM

KOUBBI P., ROBUCHON M., LEROY B., GODET C., SERANDOUR B., COTTÉ C. (2019) Biogéographie pélagique de l'océan Indien Sud à l'océan Austral. 15ième journées scientifiques du CNFRA (Comité National Français de Recherches Arctiques et Antarctiques.

MDCPR VT126 : Fabri-Ruiz S., Meilland J., Koubbi P., Lo Monaco C., Cotte C., Hosie G., Terrien S., Howa H., 2015. Biogéographie des foraminifères planctoniques dans la région Indienne de l'océan Austral; contribution des données du CPR.

Références des rapports de contrats (Union européenne, FAO, Convention, Collectivités ...)

Koubbi P., Godet C., Robuchon M., Leroy B., Serandour B., Cotté C. (2018) Delivrable 4.6: Atlas of the main mesopelagic fish in the Southern Ocean. European Project H2020 MESOPP (Mesopelagic Southern Ocean Prey and Predators)

DEA ou MASTER 2 ayant utilisé les données de la campagne

Barry Fatoumata Binta (2021) : Analyse comparative d'espèces de krill polaires, subpolaires et subtropicales : une approche transcriptomique de l'effet de la température. Master bio-informatique - Université de Paris (Co-direction : J-Y Toullec et Erwan Corre)

Thellier Marion (2021) : Estimation de la biodiversité pélagique potentielle dans les eaux subtropicales de l'océan Indien incluant les îles St Paul et Amsterdam. Master Sciences de la Mer - Sorbonne Université (co-dirigé par : Philippe Koubbi et Camille Merland)

Serandour B. (2018). Biogéographie des myctophidés et des euphausiacés de l'océan Austral. Thèse de Master en Océanographie et Environnements marins. Sorbonne Université

Godet Claire (2017). Étude des variations d'abondance du zooplancton dans la partie indienne de l'océan Austral : influence des migrations nycthémérales et des paramètres environnementaux. Master Sciences de l'Univers, Environnement, Écologie - Sorbonne Université (codirigée par Marine Robuchon, Boris Leroy et Cédric Cotté).

MDCPT VT136, VT137 et VT143 : Da Silva O., 2015. Zooplancton de la région de Crozet, Océan Austral. Master 1 SDUEE Océanographie et Environnements Marins, UPMC (encadrée par P. Koubbi et S. Fabri-Ruiz).

MDCPR VT126 : Fabri-Ruiz S., 2014. Biogéographie des foraminifères planctoniques dans la zone de Crozet, Kerguelen et Saint-Paul Amsterdam, Master 2 SDUEE Océanographie et Environnements Marins, UPMC (encadrée par P.Koubbi, H.Howa).

Thèses ayant utilisé les données de la campagne

Sergi Sara (2021). Apport en nutriments par les monts sous-marins et les vents hydrothermaux dans l’océan Austral : effets sur les écosystèmes pélagiques et implications pour la conservation / Nutrient input from seamounts and hydrothermal vents in the Southern Ocean : impacts on the pelagic ecosystems and implications for conservation. PhD Thesis, Université Sorbonne.

MDCRP VT126 : Meilland Julie. UMR LPG-BIAF (Université d?Angers). Rôle des foraminifères planctoniques dans le cycle du carbone marin des hautes latitudes (Océan Indien Austral), 212 pp. Thèse Biogéosciences de l?Université d?Angers, à soutenir le 26 Novembre 2015. (Un chapitre de la thèse concerne les échantillonnages par CPR).