POTESMER 2007

Type Campagne océanographique
Navire Téthys II
Propriétaire navire CNRS jusqu'en 2019 - IFREMER depuis 2020
Dates 01/05/2007 - 13/05/2007
Chef(s) de mission GREGORI Gérald

INSTITUT MÉDITERRANÉEN D'OCÉANOLOGIE - UMR 7294 UMR IRD 235 - MARSEILLE

163 avenue de Luminy

Bâtiment Méditerranée

13288 Marseille Cedex 9

+33(0)4 86 09 05 00

https://www.mio.osupytheas.fr/fr/linstitut-mediterraneen-doceanologie/presentation-2/

DOI 10.17600/7450080
Objectif

Cette campagne s'insère dans le programme ANR POTES piloté par Christian TAMBURINI dont le but est de caractériser les effets de l'accroissement de la pression hydrostatique sur :

  • les processus de minéralisation de la matière organique et de régénération des éléments biogéniques dans les eaux intermédiaires et profondes ;
  • la dynamique structurelle (biodiversité) et fonctionnelle (activités) des communautés procaryotiques ;
  • le rôle des virus dans le domaine océanique profond ;
  • le rôle des bactéries bioluminescentes dans le domaine océanique profond ;
  • le flux de MOP dans la colonne d'eau ainsi que la vitesse de transformation de ces particules dans la couche mésopélagique ; ces informations seront intégrées dans un modèle décrivant la transformation des particules par les micro-organismes dans toute la colonne d'eau océanique.

Pour répondre à ces objectifs un certain nombre de développements technologiques ont été développés. La campagne POTES Mer a été essentiellement destinée à les tester in situ (nouveaux instruments, nouveaux protocoles d'analyse). Cette campagne est rattachée au programme ANR POTES, labellisé Pôle Mer par le Pôle de compétitivité PACA.

Contexte scientifique et programmatique des campagnes

Résultats majeurs

Bibliographie

Publications

Ramondenc Simon, Goutx Madeleine, Lombard Fabien, Santinelli Chiara, Stemmann Lars, Gorsky Gabriel, Guidi Lionel (2016). An initial carbon export assessment in the Mediterranean Sea based on drifting sediment traps and the Underwater Vision Profiler data sets. Deep-sea Research Part I-oceanographic Research Papers, 117, 107-119. https://doi.org/10.1016/j.dsr.2016.08.015


Tamburini Christian, Boutrif Mehdi, Garel Marc, Colwell Rita R., Deming Jody W. (2013). Prokaryotic responses to hydrostatic pressure in the ocean - a review. Environmental Microbiology, 15(5), 1262-1274. https://doi.org/10.1111/1462-2920.12084


Boutrif Mehdi, Garel Marc, Cottrell Matthew T., Tamburini Christian (2011). Assimilation of marine extracellular polymeric substances by deep-sea prokaryotes in the NW Mediterranean Sea. Environmental Microbiology Reports, 3(6), 705-709. https://doi.org/10.1111/j.1758-2229.2011.00285.x


Picheral Marc, Guidi Lionel, Stemmann Lars, Karl David M., Iddaoud Ghizlaine, Gorsky Gabriel (2010). The Underwater Vision Profiler 5: An advanced instrument for high spatial resolution studies of particle size spectra and zooplankton. Limnology And Oceanography-methods, 8, 462-473. Publisher's official version : https://doi.org/10.4319/lom.2010.8.462 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00133/24413/


Tapilatu Y., Acquaviva M., Guigue C., Miralles G., Bertrand J.-C., Cuny P. (2010). Isolation of alkane-degrading bacteria from deep-sea Mediterranean sediments. Letters in Applied Microbiology, 50(2), 234-236. Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/j.1472-765X.2009.02766.x , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00303/41417/


Duhamel Solange, Gregori Gerald, Van Wambeke France, Mauriac Romain, Nedoma Jiri (2008). A method for analysing phosphatase activity in aquatic bacteria at the single cell level using flow cytometry. Journal of Microbiological Methods, 75(2), 269-278. https://doi.org/10.1016/j.mimet.2008.06.018


Danovaro Roberto, Dell'Anno Antonio, Corinaldesi Cinzia, Magagnini Mirko, Noble Rachel, Tamburini Christian, Weinbauer Markus (2008). Major viral impact on the functioning of benthic deep-sea ecosystems. Nature, 454(7208), 1084-1088. https://doi.org/10.1038/nature07268


Références des publications parues dans d'autres revues ou des ouvrages scientifiques faisant référence dans la discipline

Joux F, Bertrand J-C, De Wit R, Grossi V, Intertagla L, Lebaron P, Michotey V, Normand P, Peyret P, Raimbault P, Tamburini C, Urios L (2011) Chapitre 17: Méthodes d?études des micro-organismes dans l?environnement. In: Presses Université de Pau (ed) Écologie microbienne. Microbiologie des milieux naturels anthropisés. Bertrand JC, Caumette P, Lebaron P, pp 795-872

Références des articles parus dans des revues ou des journaux à grand public

Tamburini C. & POTES Team. POTES - Pressure effects On marine prokaryoTES, an IMBER endorsed project. IMBER Science Highlight, IMBER Update Issue n°10, June 2008.

Tamburini C., Bartlett D.H., Colwell R.R., Deming J.W., Kato C., Patching J.W., Turley C.M. Accurately measuring deep-sea microbial activities and their impacts on biogeochemical cycles. IMBER Science Highlight, IMBER Update Issue n°9, February 2008.

Références des communications dans des colloques internationaux

Tamburini C. Pressure effects: to be or not to be? Why we must consider it? Oral presentation to the ASLO aquatic science meeting, France, Nice, 25-30 January 2009.

Tamburini C., Boutrif M.*, Garel M., Al Ali B.*, Charrière B., Cuny P., Goutx M., Grégori G., Grossi V., Guigue C., Kirchman D.L., Lee C., Lefèvre D., Pepa S., Panagiotopoulos C., Sempéré R. Effect of pressure on prokaryotic degradation of organic matter according to its quality/composition. Invited speaker to "The Microbial Carbon Pump in the Ocean (MCP)" Working Group (SCOR-WG134), XIAMEN, China, October 27th-30th 2009

Boutrif M., Garel M. Tamburini C. "Pressure effect on degradation of organic matter by deep-sea prokarytic communities". Poster to the First IMBER IMBIZO: ?Integrating biogeochemistry and ecosystems in a changing ocean?, Miami, FL, USA, November 9th-13th 2008.

Sempéré R., Panagiotopoulos C., Tamburini C., Repeta D.J., Charrière B. "Dissolved organic matter (DOM) distribution in the water column of the Ocean: composition and bacterial reactivity." Oral presentation to the First IMBER IMBIZO: "Integrating biogeochemistry and ecosystems in a changing ocean", Miami, FL, USA, November 9th-13th 2008.

Tamburini C., Boutrif M., Charrière B., Cuny P., Garel M., Goutx M., Grégori G., Grossi V., Guigue C., Kirchman D.L., Lee C., Lefèvre D., Repeta D.J., Sempéré R., Wakeham S. "Pressure effects on mineralization of the organic matter by prokaryotes in meso- and bathypelagic waters of the Ocean." Oral presentation to the First IMBER IMBIZO: ?Integrating biogeochemistry and ecosystems in a changing ocean?, Miami, FL, USA, November 9th-13th 2008.

Tamburini C., Goutx M., Guigue C., Garel M., Lefèvre D., Charrière B., Sempéré R., Kirchman D.L., Peterson M.L., Wakeham S. & Lee C. Sinking particles and remineralization rates: controversies and new insights. Solicited speaker to the EurOceans Workshop: "Shedding light on the dark ocean: breaking paradigms in biogeochemistry, diversity and plankton metabolism in the meso- and bathypelagic realm". Noordwijkerhout, Netherlands, February 4th-8th 2008.

DEA ou MASTER 2 ayant utilisé les données de la campagne

ROBERT Anne. Minéralisation de la matière organique en milieu profond. LMGEM, 2006.

Thèses ayant utilisé les données de la campagne

AL ALI Badr. Laboratoire LMGEM. Effet de la pression hydrostatique sur la distribution et l'activité (bioluminescence, dégradation de la matière organique) de différents microorganismes marins. Doctorat de l'Université de la Méditerranée, spécialité Océanologie soutenue le 25 janvier 2010. Co-directrice: France Van Wambeke (HDR). Bourse du gouvernement Syrien. Octobre 2006 ? Janvier 2010.

MARTINI Séverine. Laboratoire LMGEM (et M.I.O) La bioluminescence: un proxy biogéochimique en milieu profond? Étude au laboratoire et in situ de la bioluminescence en relation avec les variables environnementales. Octobre 2010 - Décembre 2013. Bourse MNRT.

Tapilatu Yosmina. Laboratoire LMGEM. "Activité hydrocarbonoclaste de procaryotes dans des milieux extrêmes (hyperbares et hypersales)". Avril 2010.

BOUTRIF Mehdi. Laboratoire LMGEM. Dégradation de la matière organique labile et semi-labile dans les domaines méso- et bathypélagique: effet de la pression hydrostatique. Doctorat de l'Université de la Méditerranée, spécialité Océanologie. Co-directeur : Richard Sempéré (HDR). Octobre 2008 - Juillet 2012. Bourse MNRT.

ROBERT Anne. Laboratoire LMGEM. Minéralisation de la matière organique en milieu profond: validation du IODA6000 (In situ Oxygen Deep Auto-sampler). Avril 2007 - Septembre 2012. Contrat EuroSITES. Encadrant secondaire.

DUHAMEL Solange. Laboratoire LMGEM. Rôle des bactéries hétérotrophes et des producteurs primaires dans le cycle biogéochimique du phosphate : couplage des flux de carbone et de phosphate en relation avec la structure fonctionnelle des communautés. Octobre 2004 - Octobre 2007.