A - Objectifs

L'objectif de cette campagne était double : (1) Appui aux Politiques Publiques pour tout ce qui concerne la DCSMM et la mesure de l'étendue de l'habitat (descripteur 6); (2) Recherche pour la partie génétique des populations.

L'objectif principal était de réaliser la cartographie haute résolution des populations de coraux constructeurs de récifs Madrepora oculata et Desmophyllum pertusum (syn. Lophelia pertusa) du canyon de Lacaze-Duthiers. La distribution connue avant cette campagne en mer était constituée d'observations réalisées à partir de ROV Achille de la Comex (Campagnes Medseacan et Marum, 2009), ces observations avaient permis de localiser des coraux en tête de canyon (Fabri et al., 2014; Fiala-Medioni et al., 2012). Cependant, ces plongées ne permettaient pas de cartographier l'étendue de leurs populations (champ de caméra trop réduit). Pour cela une acquisition méthodique et exhaustive sur les différents sites connus dans le canyon était nécessaire et techniquement possible avec le H-ROV Ariane.

Le second objectif de cette campagne était de réaliser des prélèvements de coraux afin d'analyser la connectivité entre les populations du canyon de Lacaze-Duthiers, celles du canyon de Cassidaigne, et celles de l'Atlantique, dans le cadre du projet européen H2020-ATLAS (Arnaud-Haond et al., 2017; Becheler et al., 2017a; Becheler et al., 2017b; Dubois et al., 2016).

B- Résultats escomptés

Les résultats issus de l'analyse des vidéos ont permis de produire des cartes de distribution et de densité des deux espèces de coraux dans le canyon de Lacaze-Duthiers. Ces espèces forment des écosystèmes marins vulnérables à l'habitat morcelé (Davies et al., 2017). Ces informations ont complété le manque de connaissances sur les écosystèmes profonds mis en évidence par la DCSMM, et ont apporté des données et des informations pour le projet européen IDEM (Implementation of the MSFD in the Deep Sea Mediterranean).

Les résultats concernant la génétique des populations ont alimenté le projet ATLAS (Projet Européen H2020 : A Trans-Atlantic assessment and deep-water ecosystem-based spatial management plan for Europe 2016-2020), qui bien qu'axé sur les écosystèmes atlantiques, incluait une part significative de collecte de données pour comprendre les liens de connectivité (océanographiques et biologiques), passés et présents, entre l'Atlantique et la Méditerranée, ainsi que leur influence sur les peuplements à l'échelle des deux bassins océaniques.

De plus, les deux coraux constructeurs de récifs faisaient partie du projet eDNAbyss (appel à grand projet France Génomique), dans lequel leur séquençage génomique était prévu au Génoscope. Le séquençage d'un génome nécessite une grande quantité d'ADN provenant d'un seul individu (ici une seule colonie sans suspicion d'anastomose de fragments d'origines différentes). L'obtention de tissus frais conditionnés spécifiquement dans cet objectif a été réalisée pour D.pertusum (syn. L. pertusa), espèce pour laquelle les échantillons en collection ne présentaient ni la qualité ou ni la quantité suffisante. Son génome a ainsi pu être entièrement séquencé.