Le principal objectif de cette campagne est d'analyser les changements de biodiversité (structurelle et fonctionnelle) d'un écosystème benthique côtier (les fonds meubles envasés de la rade de Brest) sous l'influence d'une espèce invasive (la crépidule), et ce, par le biais d'une technique d'imagerie innovante qui se veut complémentaire des méthodes classiques de prélèvements quantitatifs.

Pour ce faire, le système d'imagerie « Pagure-2 » (développé dans le cadre de JERICO-Next ; voir plus loin) sera déployé et tracté au-dessus du fond sur plusieurs sites présentant différents niveaux de colonisation par la crépidule, l'ensemble de la zone d'étude représentant un gradient de biomasse de crépidule, le tout sur un type d'habitat le plus homogène possible (fonds meubles envasés).

Cette approche permettra en premier lieu de décrire les changements de composition faunistique au niveau de l'épifaune (richesse taxonomique, abondance, représentativité des principaux traits morphologiques), en fonction du facteur « crépidule ». Plus spécifiquement, l'influence de ce facteur « crépidule » sera analysée selon deux composantes : i) la biomasse de crépidules vivantes, qui permet d'étudier les effets allogéniques (ceux dus à l'activité biologique de la crépidule) et ii) la quantité de coquilles de crépidules, qui permet d'étudier les effets autogéniques (ceux dus à la seule présence physique des coquilles). En pratique, la stratégie d'échantillonnage nous permettra d'analyser d'une part les effets autogéniques seuls sur des bancs de crépidules mortes (incluant un gradient de quantité de coquilles), et d'autre part les effets conjugués allogéniques et autogéniques sur les bancs de crépidules vivantes (incluant un gradient de biomasse de crépidules vivantes, mais toujours associé à des coquilles vides).

Outre l'identification et le dénombrement des organismes benthiques de l'épifaune sur la base des vidéos et des photos, la technique d'imagerie permettra également d'analyser de manière qualitative (ou semi-quantitative) certaines caractéristiques bio-physiques de l'interface eau-sédiment comme les traces de bioturbation (présence de tubes et de biodépots) et la présence de biofilm (microphytobenthos subtidal).

Dans un second temps, le but sera de combiner les données de biodiversité benthiques originales obtenues par imagerie vidéo et photo durant la campagne Pagure-Next-2018 avec des données de biodiversité benthique déjà existantes obtenues sur les mêmes sites grâce à des campagnes de prélèvements classiques à la benne (projets « REBENT-RADE » et EC2CO « EVOCREP »). Cet objectif est d'appréhender de manière plus globale l'impact de la crépidule sur la biodiversité benthique, c'est-à-dire en prenant en compte l'endofaune et l'épifaune (y compris les espèces dispersées).