PHYCO

Name: PHYCO
Start: 2017-04-21
End: 2017-04-29
Location: Manche

Type	Campagne océanographique
Navire	Côtes De La Manche
Propriétaire navire	CNRS jusqu'en 2019 - IFREMER depuis 2020
Dates	21/04/2017 - 29/04/2017
Chef(s) de mission	ARTIGAS Luis Felipe
	LABORATOIRE D'OCÉANOLOGIE ET DE GÉOSCIENCES - UMR 8187 28 avenue Foch BP 80 62930 Wimereux +33(0)3 21 99 29 00 log-com@univ-littoral.fr https://log.cnrs.fr/
DOI	10.17600/17010500
Objectif	La campagne PHYCO est consacrée à l'étude du bloom phytoplanctonique printanier dans la Manche est et le sud de la mer du Nord, en combinant à la fois des méthodes d'échantillonnage de référence et des méthodes d'observation à haute résolution du phytoplancton. Les caractéristiques biogéochimiques, l'environnement bio-optique, la distribution et la caractérisation des communautés phytoplanctoniques sont étudiées le long de gradients côte-large et est-ouest des deux côtés de la Manche, depuis la baie de Seine jusqu'au détroit du Pas de Calais. Les suivis sont réalisés à haute résolution spatiale et temporelle, lors d'une saison caractérisée par les blooms phytoplanctoniques (particulièrement celui des diatomées et de l'haptophyte Phaeocystis globosa) ainsi qu'une forte hétérogénéité spatiale et changements rapides dans les communautés. Des enregistrements in situ en continu en sub-surface sont combinés à des échantillonnages discrets (à différentes profondeurs) et des profils à des stations fixes. L'abondance, la composition (groupes fonctionnels, taxonomie) et l'état physiologique des assemblages phytoplanctoniques sont caractérisés à l'aide des techniques suivantes : fluorimétrie multi-spectrale in situ, cytométrie en flux automatisée de type pulse shape-recording, acquisition et analyse d'image, fluorimétrie variable de type Pulse Amplitude Fluorometry (PAM) et Fast Repetition Rate Fluorometry (FRRF). Les espèces phytoplanctoniques et les groupes pigmentaires sont déterminés par des méthodes de référence : observation microscopique et analyses des pigments. La campagne PHYCO permets également de recueillir la réflectance marine ainsi que les propriétés optiques de la matière dissoute et particulaire afin de calibrer et de permettre la discrimination des types fonctionnels du phytoplancton (phytoplancton functional types - PFT) depuis l'espace. Cette campagne est la première d'une série de trois campagnes de déploiement de techniques innovantes semi-automatisées pour la définition d'une observation en temps réel du phytoplancton et des HABs dans le cadre d'une Joint Research Action (JRAP # 1) du projet H2020 JERICO-Next (www.jerico-ri.eu). Elle constitue une suite du projet INTERREG IV A "2 Seas" DYMAPHY et représente une action d'observation du projet CPER MARCO (Région Hauts de France) ainsi qu'une action de suivi exploratoire du Programme de Surveillance de la Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM) pour la thématique Habitats Pélagiques. Autre projet de rattachement : CONVENTION DCSMM N° 2101893310 entre le MINISTÈRE DE L'ENVIRONNEMENT DE L'ÉNERGIE ET DE LA MER - MEEM (actuellement Ministère de la Transition Ecologique et Solidaire - MTES) et le CNRS INSU - Mission d'appui scientifique et technique à la mise en oeuvre de la Directive-cadre stratégie pour les milieux marins - DCSMM pour les Habitats Pélagiques (en ce qui concerne l'UMR LOG et les campagnes PHYCO et ECOPEL qui sont des campagnes préliminaires à la mise en place du Programme de Surveillance de la DCSMM.

Mer/Océan

Manche

(Manche Orientale)

Ports

Port départ : Boulogne (France)

Port fin : Boulogne (France)

Limites

Nord	Sud	Ouest	Est
51.1	49.4	-1.6	1.6

Projet

JERICO-NEXT : RÉSEAU EUROPÉEN D'OBSERVATION DE L'ENVIRONNEMENT CÔTIER

Organisme responsable de la campagne

LABORATOIRE D'OCÉANOLOGIE ET DE GÉOSCIENCES - UMR 8187

28 avenue Foch

BP 80

62930 Wimereux

+33(0)3 21 99 29 00

log-com@univ-littoral.fr

https://log.cnrs.fr/

Organisme(s) participant(s)

ULCO, CNRS, UdL, IFREMER, Cefas

Discipline(s)

MULTIDISCIPLINES
BIOLOGIE MARINE
ENVIRONNEMENT
OCEANOGRAPHIE PHYSIQUE

Code	Libellé	Quantité	Responsable
B01	Production primaire La production primaire du phytoplancton a été approchée par l'étude des paramètres photosynthétiques via des profils et des enregistrements en continu au moyen de la technique de Fast Repetition Rate Fluorescence. Des estimations des paramètres photosynthétiques ont aussi été réalisées sur des échantillons discrets prélevés à la bouteille Niskin par la technique de fluorescence variable via des pulsations de lumière à amplitude modulée (Phyto-PAM).	500 Mesures	LIZON Fabrice
B02	Pigments phytoplanctoniques Les concentrations en chlorophylle a et les phaeopigments ont été mesurés sur des extraits organiques (acétone à 90 %) à partir de filtres d'échantillons d'eau, par le biais d'un fluorimètre de paillasse Turner Designs 10-AU. La mesure des concentrations d'autres pigments devrait effectuée par HPLC (Chromatographie Liquide à Haute Performance).	48 Stations	ARTIGAS Luis Felipe
B03	Seston Les matières en suspension (MES) sont déterminées via les filtrations des échantillons discrets sur des filtres GF/F 47mm pré-pesés.	48 Echantillons	ARTIGAS Luis Felipe
B07	Bactéries et microorg. pélagiques Les bactéries et divers micro-organismes pélagiques sont quantifiés au cytomètre en flux après un marquage d'ADN par un fluorochrome.	48 Echantillons	ARTIGAS Luis Felipe
B08	Phytoplancton La diversité et abondance du phytoplancton sont étudiées sur des échantillons discrets fixés au lugol, au microscope à inversion ainsi qu'au microscope électronique à balayage.	48 Echantillons	ARTIGAS Luis Felipe
B09	Zooplancton La diversité et l'abondance du zooplancton sont analysées à la loupe binoculaire et au ZoosCan sur des échantillons fixés au formol et récoltés au filet à plancton WP2.	27 Echantillons	LOOTS Christophe
B13	Oeufs et larves La caractérisation et l'abondance de l'ichthyoplancton (oeufs et larves de poissons) sont analysées à la loupe binoculaire et au ZoosCan sur des échantillons fixés et récoltés au filet à plancton de type Bongo.	27 Echantillons	LOOTS Christophe
B64	Essais d'équipements ou d'engins Utilisation en profileur du Fast Repetition Rate Fluorescence (FRRF) permettant l'estimation des paramètres photosynthétiques du phytoplancton.	48 Profils	LIZON Fabrice
B71	Matière organique particulaire La concentration en matière organique particulaire, notamLa concentration en matière organique particulaire, notamment, le Carbone Organique Particulaire (COP) est estimée sur des échantillons d'eau discrets. Après filtration sous vide à travers des filktres calcinés, rinçage aux réactifs et décarbonatation, les filtres sont passés à l'analyseur CHN.	48 Echantillons	MERIAUX Xavier
B90	Autres mesures biol. ou halieut. Le suivi des groupes spectraux phytoplanctoniques a été réalisée en continu en sub-surface et lors de profils via l'excitation de la chlorophylle a, pigments accessoires et CDOM par des fluorimètres multi-spectraux de type AlgaeOnlineAnalyser et FluoroProbe. De plus, la cytométrie en flux automatisée (de type CytoSense/Sub) a permis d'estimer l'abondance et fluorescence par cellules/colonies, classes de taille et groupes fonctionnels phytoplanctoniques.	700 Mesures	ARTIGAS Luis Felipe
H09	Bouteilles Prélèvement d'eau à l'aide de bouteilles hydrologiques (Niskin) de 8L en surface et 5L en profondeur.	48 Stations	ARTIGAS Luis Felipe
H10	Stations bathysonde Des profils de bathysonde CTD SBE25 Seabird ont permis de mesurerla température, la pression/profondeur, la conductivité/salinité, la transmittance, la lumière photonsyntétiquement active (PAR), O2 dissous et la fluorescence in vivo totale de la chlorophylle a.	47 Profils	ARTIGAS Luis Felipe
H11	Mesures (T,S) subsurface en route Enregistrements en continu en eaux de sub-surface au moyen d'un Pocket Ferry Box (IFREMER) associé au circuit du thermosalinomètre du bateau, mesurant la température, la salinité, le CDOM, Oxygène dissous, et 4 groupes phytoplanctoniques (fluorimétrie multi-spectrale)	5000 Mesures	LEFEBVRE Alain
H17	Mesures optiques Des propriétés optiques inhérentes (IOPs; fluorescence, absorption, rétrodiffusion) ainsi que des propriétés optiques apparentes (AOPs; réflectance) des eaux marines ont été mesurées de par une "grappe optique" combinant plusieurs capteurs et des capteurs TRIOS, respectivement.	47 Stations	MERIAUX Xavier
H22	Phosphates Le dosage des phosphates se fait par l'auto-analyseur AA3 et permet de calculer la concentration présente dans l'échantillon sur le principe de la colorimétrie.	48 Echantillons	ARTIGAS Luis Felipe
H24	Nitrates Le dosage des nitrates se fait par l'auto-analyseur AA3 et permet de calculer la concentration présente dans l'échantillon après passage dans une colonne de cadmium sur le principe de la colorimétrie.	48 Echantillons	ARTIGAS Luis Felipe
H25	Nitrites Le dosage des nitrites se fait par l'auto-analyseur AA3 et permet de calculer la concentration présente dans l'échantillon sur le principe de la colorimétrie.	48 Echantillons	ARTIGAS Luis Felipe
H26	Silicates Le dosage des silicates est réalisé par l'auto-analyseur AA3 et permet de calculer la concentration présente dans l'échantillon sur le principe de la colorimétrie.	48 Echantillons	ARTIGAS Luis Felipe
H76	Ammonium Le dosage de l'ammonium est réalisé par fluorimétrie après l'ajout d'un réactif mélangé stable. Le dosage est basé sur la réaction de l'ion ammonium avec l'orthophtaldialdéhyde permettant d'obtenir la concentration en ammonium.	48 Echantillons	ARTIGAS Luis Felipe
H90	Autres mesures chimiques dans l eau La concentration en carbone inorganique particulaire (PIC) est obtenue après soustraction du carbone organique particulaire au carbone total. La concentration en Matière Organique Dissoute Chromophorique (CDOM) est mesurée au spectrophotomètre sur des échantillons d¿eau après filtration.	48 Echantillons	MERIAUX Xavier

Données publiées

Giraldo Carolina, Fontaine Virginie, Lefebvre Sebastien, Lefebvre Valerie, Caboche Josselin, Couvreur Clemence, Lebon Fabien, Delegrange Alice, Antajan Elvire (2024). A matter of size and season: insights into planktonic food-web dynamics in a temperate coastal ecosystem: Raw data. https://doi.org/10.17882/97229

Bibliographie

Publications

Louchart Arnaud, Lizon Fabrice, Debusschere Elisabeth, Mortelmans Jonas, Rijkeboer Machteld, Crouvoisier Muriel, Lebourg Emeline, Deneudt Klaas, Schmitt François G., Artigas Luis Felipe (2024). The importance of niches in defining phytoplankton functional beta diversity during a spring bloom. Marine Biology, 171(1), 26 (22p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.1007/s00227-023-04346-6 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00866/97805/

Giraldo Carolina , Cresson Pierre , Mackenzie Kirsteen , Fontaine Virginie, Loots Christophe , Delegrange Alice, Lefebvre Sebastien (2024). Insights into planktonic food-web dynamics through the lens of size and season. Scientific Reports, 14(1), 1684 (17p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.1038/s41598-024-52256-4 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00872/98439/

Di Pane Julien, Koubbi Philippe, Gendrot F., Giraldo Carolina , Karasiewicz Stephane, Marchal Paul , Loots Christophe (2021). Investigating environmental influence and temporal changes in sole (Solea solea) larvae condition using histology. Estuarine Coastal And Shelf Science, 250, 107161 (11p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ecss.2020.107161 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00666/77774/

Di Pane Julien, Gendrot F., Giraldo Carolina , Marchal Paul , Koubbi Philippe, Loots Christophe (2020). Evaluating the histological-based condition of wild collected larval fish: A synthetic approach applied to common sole (Solea solea). Journal Of Marine Systems, 204, 103309 (10p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.jmarsys.2020.103309 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00601/71325/

Di Pane Julien, Koubbi Philippe, Giraldo Carolina , Lefebvre Valerie, Caboche Josselin, Marchal Paul , Loots Christophe (2020). Recent changes in ichthyoplanktonic assemblages of the eastern English Channel. Journal Of Sea Research, 157, 101848 (9p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.seares.2020.101848 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00604/71631/

Références des rapports techniques

Fontaine Virginie (2020). Dynamique et structure du réseau trophique planctonique en Manche-Est. Rapport de Stage de 2éme année de Master Biodiversité, Ecologie, Evolution (BEE). Parcours FOnctionnement et Gestion des Ecosystèmes Marins (FOGEM). Université de Lille.

Jouandet Marie-Pâule, Lebourg Emeline, Bruault Marie, Dedecker Claire, Louchart Arnaud, Gomez Fernando, Nowaczyck Antoine, Wacquet Guillaume, Lizon Fabrice, Crouvoisier Muriel, Cornille Vincent, Lefebvre Kévin, Bouchaud Fanny, Lécuyer Eric, Mériaux Xavier, Cauvin Arnaud, Didry Morgane, Delabre Jessica, Duflos Marie, Artigas Luis Felipe (2020). Résultats des campagnes océanographiques 2017- 2019 en Mers Celtiques et Manche Mer du Nord. Test pour la mise en place du Programme de Surveillance DCSMM. [PHYCO 2017 - PELRAD 2017 - ECOPEL 2018 leg 1 et leg 2 - CGFS 2018 - IBTS 2018 et 2019].

Jouandet M-P., Lebourg E., Bruaut M., Dédécker C., Louchart A., Gómez F., Nowaczyck A., Wacquet G., Lizon F., Crouvoisier M., Cornille V., Lefebvre K., Bouchaud F., Lécuyer E., Mériaux X., Cauvin A., Didry M., Delarbre J., Duflos M. et Artigas L. F., 2020. Résultats des campagnes océanographiques 2017-2019 en Mers Celtiques et Manche Mer du Nord : Test pour la mise en place du Programme de Surveillance DCSMM. 113 pp.

Lizon F., Artigas L.F., Louchart A., Michel-Rodríguez M., Pernak. M. (2020) Résultats des campagnes océanographiques 2017-2019 en Mers Celtiques et Manche Mer du Nord : Test pour la mise en place du Programme de surveillance de la DCSMM - Apports de la Fluorescence Variable FV de type FRRF (Fast Repetition Rate fluorometer), sur la caractérisation biologique des masses d'eau (campagnes préliminaires et exploratoires 2017-2019), 49 pp.

Lhériau Alexandre (2019). Estimation de la condition larvaire de la sole commune (Solea solea) en Manche Orientale. Rapport de stage de Master Sciences de la Mer. Université Sorbonne.

Vallet Quentin (2019). Variations de la condition larvaire chez le Sprat en Manche Orientale et Sud de la Mer du Nord. Rapport de stage de Master Sciences de la Mer. Université Sorbonne.

Jouandet M-P., Petit L., Duflos M., Wacquet G., Dédécker C., Aubert A., Rombouts I., Mialet B., Lebourg E., Bruaut M., Gómez F., Nowaszyk A., Delarbre J., Cornille V., Lécuyer E., Didry M., Lizon et Artigas L. F., 2019. Mise en oeuvre du programme de surveillance Habitats Pélagiques : test de mise en place des campagnes saisonnières et calcul d'indicateurs sur le site atelier Manche Mer du Nord et Mers Celtiques. 127 pp.

Artigas F., Créach V., Houliez H., Karlson B., Lizon F., Seppälä J., Wacquet G. (2019) Novel methods for automated in situ observations of phytoplankton diversity and productivity: synthesis of exploration, inter comparisons and improvements. JERICO-NEXT-WP3-D3.2, 85 pages. https://www.jerico-ri.eu/download/jerico-next-deliverables/JERICO-NEXT_Deliverable_3.2_130819_V5.pdf

Despinoy Carole, Puillat Ingrid (2018). Proceeding of poster session. 2nd JERICO-NEXT week. Galway, IR, 24-27 Sept.2018. https://archimer.ifremer.fr/doc/00594/70589/

Gendrot Félix (2018). Variations spatiale et temporelle de la condition larvaire lors de la période critique de trois espèces de poissons en Manche orientale : approche par indices histologiques. Mémoire de Master Sciences de l’Univers, Environnement, Écologie. Spécialité : Océanographie et Environnements Marins. Univesité Sorbonne.

Karlson B., Artigas L.-F., Creach V., Louchart A., Wacquet G., Seppala J. (2017) Novel methods for automated in situ observations of phytoplankton diversity. Work package 3, Deliverable 3.1 of JERICO-Next project, 69 pages.

Karlson B., Artigas L.-F., Louchart A., Seppälä J., Claquin P., Colas F., Créach V., de Blok R., Deneudt K., Grégori G., Kromkamp J., Lefebvre A., Lizon F., Möller K., Rijkeboer M., Stemmann L., Thyssen M., Tyberghein L., Wacquet G. (2017) Contribution to the JRAP#1: Phytoplankton biodiversity and HAB (Biodiversity of phytoplankton, harmful algal blooms and eutrophication), Progress Report #2. Work package 4, Deliverable 4.3 of JERICO-Next project, 66 pages.

https://www.jerico-ri.eu/download/jerico-next-deliverables/JERICO-NEXT_Deliverable_3.2_130819_V5.pdf