IPARO

Type Campagne océanographique
Navire Côtes De La Manche
Propriétaire navire CNRS jusqu'en 2019 - IFREMER depuis 2020
Dates 10/09/2015 - 15/09/2015
Chef(s) de mission COLAS Florent ORCID

RECHERCHES ET DÉVELOPPEMENTS TECHNOLOGIQUES

Centre Ifremer Bretagne

ZI Pointe du Diable

CS 10070

29280 Plouzané

+33(0) 2 98 22 41 41

https://rd-technologiques.ifremer.fr/

DOI 10.17600/15012700
Objectif Depuis maintenant une dizaine d'année, les techniques d'imagerie couplées à des algorithmes de classification supervisée se sont montrées efficaces pour l'analyse de la diversité des populations planctoniques. L'idée est de prendre les images des organismes contenus dans un échantillon, de calculer les paramètres morphométriques pertinents sur chaque image et de réaliser une classification d'après une base de données préalablement constituée et appelée set d'apprentissage. Depuis maintenant deux ans, les unités REM-RDT et ODE-DYNECO collaborent au développement de deux systèmes, le MicroZooCAM et le FastCAM. Le premier est destiné à l'analyse du zooplancton, le second à celle du phytoplancton. L'objectif de la campagne IPARO est d'évaluer ces deux équipements en conditions opérationnelles. Lors de la campagne IPARO, un réseau de stations a été effectué sur la zone Sud-Bretagne, Iroise et Rade de Brest en effectuant des mesures et des prélèvements sur la verticale sur des secteurs basés sur les points de surveillance du REPHY (Réseau de Surveillance du Phytoplancton et des Phycotoxines - idem campagnes PSEUDOMO1, PSEUDOMO2, PSEUTEC et PHYTEC). Les objectifs de cette campagne sont doubles : 1) réaliser une évaluation technologique des nouveaux systèmes développés à l'Ifremer; 2) démontrer l'apport de ces méthodes pour la description structures phytoplanctonique en Bretagne Sud et Iroise. Cette large zone inclue les panaches Loire et Vilaine, et également la zone Iroise (front d'Ouessant, Rade de Brest et Baie de Douarnenez). Sur chaque station un profil vertical est réalisé à l'aide du profileur pélagique DYNECO. Lors des profils effectués sur la zone d'étude, les données et vidéo acquises en temps réel par le profileur pélagique ont permis de cibler les couches d'eau à échantillonner pour une analyse ex situ des échantillons à l'aide du FastCAM et MicroZooCAM. Un trait de filet vertical (ouverture de 50 cm de diamètre) a également été réalisé afin d'obtenir un échantillon concentré en phytoplancton et d'avoir ainsi une vision globale des espèces présentes dans la colonne d'eau. En cas de gradients verticaux bien marqués, avec un maximum de chlorophylle, nous avons également procédé à des prélèvements resserrés au niveau de ces gradients à l'aide du préleveur étagé. Une partie des échantillons est collectée pour des analyses taxonomiques à terre.

Bibliographie

Références des rapports techniques

Neaud-Masson NadineORCID, Lefebvre AlainORCID, Belin CatherineORCID, Gauthier Emilie, Huguet Antoine, Szidon Antoine, Lefebvre Arnaud, Cuvelliez Rémi (2016). Optimisation de l’identification et du dénombrement du microphytoplancton avec le système couplé de numérisation et d’analyse d’images FlowCAM / ZooPhytoImage (système innovant). Action 9 – Livrable 2. Mise en oeuvre opérationnelle de l’outil FlowCAM-Zoo/PhytoImage dans le cadre de la surveillance REPHY. Résultats sur 12- 18 mois. Rapport final, février 2016. https://archimer.ifremer.fr/doc/00363/47413/


Colas FlorentORCID, Tardivel Morgan, Evrard JustineORCID, Forest Bertrand, Crassous Marie-Pierre, Lunven Michel, Danielou Marie-Madeleine (2016). Optimisation de l’identification et du dénombrement du microphytoplancton avec le système couplé de numérisation et d’analyse d’images FlowCAM – Zoo/PhytoImage (système innovant). Action 9 – Livrable 3. Evolution du matériel de numérisation : prototype FastCAM et perspectives. Rapport final, février 2016. https://archimer.ifremer.fr/doc/00363/47420/


Thèses ayant utilisé les données de la campagne

Ramond Pierre (2018). Diversité Fonctionnelle des Protistes Marins dans l’Ecosystème Côtier / Functional Diversity of Marine Protists in Coastal Ecosystems. PhD Thesis, Université Sorbonne.