BICOSE

Type Oceanographic cruise
Ship Pourquoi pas ?
Ship owner Ifremer
Dates 10/01/2014 - 11/02/2014
Chief scientist(s) CAMBON-BONAVITA Marie-Anne ORCID

ETUDES DES ECOSYSTEMES PROFONDS

IFREMER Centre de Bretagne

ZI Pointe du diable

CS 10070

29280 PLOUZANE

+33 (0)2 98.22.43.67

https://wwz.ifremer.fr/deep

DOI 10.17600/14000100
Objective

Understanding the ecosystems of hydrothermal sites and their surrounding areas in the Atlantic: mapping and characterization of the geological and geochemical context, characterization of habitats, inventory of biodiversity in hydrothermal ecosystems and surrounding areas and geobiological connectivity and interaction.

Published data

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Data managed by SISMER

Sampling operations

Dives

Moorings

Bibliography

Publications

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References of Articles published in periodicals and magazines for the general public

Articles de journaux (l'express, Télégramme, La Croix, Ouest France, Le Monde, Wapiti, l'Humanité, Le Figaro, Les Echos, Science Ouest)

Conférences de presse, Interview (France Inter la tête au carré, France Bleue, France Antilles Martinique, RTL, NeoPlanete.com, RFI, France Info, la1er.fr, Orange.fr, plusbellematerre.com, Le progrès de Cornouaille.com, Seasailsurf.fr, Seableue.fr).

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Simon Le Bloa, Lucile Durand, Laure Taupin, Charlotte Marteau, Cambon-Bonavita M.A., Alexis Bazire. (2014) Toward a better understanding of the symbiotic relationships in Rimicaris exoculata model? 4th workshop on deep sea microbiology, 4-7 septembre Brest IUEM,

References of National Seminar Communications

Juliette Ravaux, Julia Machon, Philippe Lucas, Magali Zbinden. (2018) Les crevettes sentent-elles les sources hydrothermales ? Colloque CONNECT3, 14-16 Nov, Brest, France. Présentation orale.

Magali Zbinden, Alison Gallet, Kamil M. Szafranski, Julia Machon, Juliette Ravaux, Nelly Léger and Sébastien Duperron. (2018) Blow Your Nose, Shrimp! Unexpectedly Dense Bacterial Communities Occur on the Antennae and Antennules of Hydrothermal Vent Shrimp. Colloque CONNECT3, 14-16 Nov Brest, France. Présentation orale.

Duperron S, Piquet B, Andersen AC, Shillito B (2017) Flexibilité des symbioses chimiotrophes chez les bivalves mytilidés de l'Océan profond : résultats récents, questions ouvertes. Symposium du Réseau Ecologie des Interactions Durables, REID, 22-24 mars, Toulouse, France.

Duperron, S. (2017) Adaptation by association in the deep sea: the case of chemosynthetic symbioses in bivalves, IBPS Symposium "Symbiosis in evolution, biology and human health", Paris, 15-17 mars. Oral invité lors d'un colloque organisé par l'Institut de Biologie Paris Seine.

Duperron, S. (2017) Symbioses bactéries-animaux dans l'océan profond. Colloque La Microbiologie dans Tous ses Etats, Colloque Sorbonne Universités, Paris, 23 mai.

Mandon Perrine, Sarah SAMADI, Stéphane HOURDEZ. (2017) Recherche de marqueurs pour résoudre la position phylogénétique des Alvinocarididae au sein des Caridea. COMMUNICATION ORALE. Journée des jeunes chercheurs de l'UMR 7205 ISyEB. Paris May 4th.

Methou P, Hernandez-Avila I, Cueff-Gauchard V, Cambon-Bonavita M-A, Pradillon F. (2017) Quel type d'association microbienne sur les oeufs de la crevette Rimicaris exoculata ? VIIIe Colloque AFEM, 17-20 October, Camaret-sur-Mer (France)

S. Le Guellec, D.Courtine, A. Godfroy, et E. Roussel. (2017) Production hydrogéno-dépendante de formate par des Thermococcales hyperthermophiles. VIIIe Colloque de l'AFEM ; 17-20 octobre Camaret-sur-Mer (France).

S. Le Guellec, E. Pelleter, N. Gayet, A. Godfroy, Y. Fouquet, et E. Roussel. (2016) Identification et caractérisation fonctionnelle de précurseurs de colonisation microbienne de sulfure-massif hydrothermal (site Snake Pit). CONNECT2 ; 9-11 mai au Centre Ifremer de Brest (France).

S. Le Guellec, E. Pelleter, N. Gayet, A. Godfroy, Y. Fouquet, et E. Roussel. (2016) Identification et caractérisation fonctionnelle de précurseurs de colonisation microbienne de sulfure-massif hydrothermal (site Snake Pit). Journées thématiques de l'AFEM 2016 (Association Francophone d'Ecologie Microbienne) ; 31 mai-1er juin 2016 à Marseille (France).

Duperron, S. (2015) « La flexibilité des symbioses chez les moules, une clé de leur adaptation aux environnements à base chimiosynthétique ». Meeting CONNECT, 11-13 mai, Le Mans, France

Florence Pradillon, Ivan Hernandez, Marie-Anne Cambon-Bonavita, Jozée Sarrazin, Laurent Bignon, Cécile Cotty, Vincent Dutreuil, Loïc Dussud. (2015) « Reproduction et écologie larvaire chez la crevette Rimicaris exoculata de la ride Médio-Atlantique ». Colloque National sur la biologie et l'écologie des écosystèmes à bas de chimiosynthèse (CONNECCT), 11 au 13 mai, Le Mans

M. Zbinden, J. Machon, B. Shillito, N. Léger, J. Ravaux. (2015) "Etude comparée de l'olfaction chez la crevette hydrothermale Mirocaris fortunata et la crevette côtière Palaemon elegans". Oral COlloque National sur la biologiE et l'éCologie des éCosystèmes à base de chimiosynThèse (CONNECT). Le Mans, 11-13 Mai.

Marie-Anne Cambon-Bonavita, Lucile Durand, Mathieu Guri, Julie Ponsard, Cyrielle Jan, Valérie Cueff-Gauchard, Julie Reveillaud, Simon Le Bloa, Mohamed Jebbar, Philippe Compère, Bruce Shillito and Magali Zbinden. (2015) Oral presentation. « L'holobionte Rimicaris exoculata ». Colloque National sur la biologie et l'écologie des écosystèmes à bas de chimiosynthèse (CONNECCT), 11 au 13 mai, Le Mans.

S. Le Bloa, L. Durand, C Marteau, L. Taupin, M Zbinden, B Shillito, MA Cambon Bonavita and A. Bazire (2015) Oral presentation. « Interactions hôtes-symbiontes en environnement extrêmes : cas particulier de Rimicaris exoculata » Colloque National sur la biologie et l'écologie des écosystèmes à bas de chimiosynthèse (CONNECCT), 11 au 13 mai, Le Mans.

S. Le Guellec, E. Pelleter, Y. Fouquet, N. Gayet, C. Konn, C. Cathalot, V. Cueff-Gauchard, M.A. Cambon-Bonavita, A. Godfroy & E. Roussel (2015). Identification et caractérisation fonctionnelle de précurseurs de colonisation microbienne de sulfure-massif hydrothermal: résultats préliminaires.. COlloque National sur la biologiE et l'éCologie des éCosystèmes à base de chimiosynThèse Le Mans. (Poster)

V. Apremont, V. Cueff-Gauchard, MA Cambon-Bonavita, M. Zbinden.(2015) " Preliminary data on the investigation of hydrothermal shrimp Chorocaris chacei symbiosis". Poster COlloque National sur la biologiE et l'éCologie des éCosystèmes à base de chimiosynThèse (CONNECT). Le Mans, 11-13 Mai.

References of the Described New Species (faunal, floral, microorganisms), locations where the holotypes were stored

Mollusca, Famille Sutilizonidae, Genre Sutilizona Warén & Bouchet, 2001

Mollusca, Famille Peltospiridae, Genre Pachydermia Waren & Bouchet, 1989

Spécimens entre 1-2mm collectés sur TAG et Snake Pit. Ce genre est endémique des sources hydorthermales MAR (Snake Pit) et EPR (12-13°N). Ces espèces ont été décrites sur la base de spécimens peu nombreux et leur mode de préservation n'a pas permis de les étudier dans le cadre d'étude en systématique moléculaire. Au total, plus de 30 spécimens ont été collectés sur les deux sites. Ces échantillons seront confiés à Anders Waren (Muséum de Stockholm) pour étude.

Actuellement dans ce genre, seules deux espèces sont décrites, respectivement endémiques de la zone EPR et bassin de Lau. Sur Snake pit, site ELAN plus de 10 spécimens ont été collectés vivants avec tissus préservés en alcool. Ces spécimens seront confiés à Anders Waren pour description.

Amphipoda, Famille Dulichiidae, genre Dulichiopsis sp nov.

Observés assez fréquemment sur les zones périphériques de Snake Pit et TAG, il a été difficile dans un premier temps d'identifier les spécimens présents sur ces tiges. Après collecte et observation minutieuse in-situ, il s'avère que ce sont des amphipodes qui vivent en couple ou seul sur des tiges qu'ils construisent en agglutinant du mucus et du sédiment. Malheureusement le mode de collecte n'est pas optimal et seulement deux spécimens ont pu être récupérés. Après examen et comparaison avec la littérature, ces individus appartiennent au genre Dulichiopsis. Seules 8 espèces sont décrites dans ce genre et possèdent une distribution bathymétrique maximale de 1500m. Un examen plus détaillé de ces spécimens est nécessaire mais tout suggère que ce serait une nouvelle espèce.

Isopoda, Famille Echinothambematidae, genre Echinothambema sp.

Ces deux spécimens ont été collectés dans la zone périphérique de TAG lors du prélèvement de spécimens d'Holothuries (PL575, ASPI1). Ce genre d'isopode benthique regroupe seulement deux espèces dont une seule est présente en milieu profond (zone Pacifique). Il est probable que cette espèce soit nouvelle, à confirmer avec un spécialiste du groupe (Gary Poore, Australian Museum).

References of Contracts reports (European Union, FAO, Convention, Collectivities...)

Rapport convention CARNOT Reximmu, Août 2015 MA Cambon-Bonavita

Rapport MIDAS tous les 6 mois

Rapports d'avancement des thèses et comités de thèses des doctorants travaillant sur le sujet (voir infra)

DEA or MASTER 2 using campaign data

Liz Loutrage. Stage M1 SBM (2019) Etude intégrée de la structure et du fonctionnement des communautés faunistiques associées aux assemblages de Bathymodiolus puteoserpensis du champ hydrothermal Snake Pit, dorsale médio-Atlantique., Université de Bretagne Occidentale. J Sarrazin.

Bruno Labelle stage de Master 2, (2018) Université Pierre et Marie Curie : Etude intégrée de la structure et du fonctionnement des assemblages de gastéropodes de la dorsale médio-Atlantique.Co-encadrantes : Dr. Jozée Sarrazin et Marjolaine Matabos.

Charlène Rosazza, stage Master 1 Polytech Marseille (2018) : Etude de la diversité des épibiontes du céphalothorax et du tracatus digestif chez la crevette Rimicaris exoculata : comparaison entre mâles et femelles. Encadrement V Cueff-Gauchard et MA Cambon Bonavita

Alison Gallet Stage Master 2 - (2017) - Sorbonne Univserité, Mention Sciences de l'Univers, Environnement, Ecologie. Spécialité Océanographie et Environnements marins). Caractérisation du microbiote associé aux organes olfactifs de crevettes hydrothermales : approches microscopique et moléculaire. Encadrement : M. Zbinden / S. Duperron.

Alison Gallet: Stage de Master II, (2017), Mention SDUEE spécialité OEM. "Caractérisation du microbiote associé aux organes olfactifs de crevettes hydrothermales : approches microscopique et moléculaire". Co-encadrement M. Zbinden et S. Duperron.

Blandine Brachet : Stage de Master II (2017) Lien entre Failles de détachements et circulation hydrothermale : Exemple de la dorsale Atlantique. Mémoire de stage de Master 2 - Master Sciences de la Mer et du Littoral. Encadrement E Pelleter.

Adrien Quiles Stage Master II (2015) Microbiologie Environnement Santé - MNHN) Dynamique des populations de bactéries symbiotiques méthanotrophes et thiotrophes chez la moule hydrothermale bathymodiolus puteoserpentis. Encadrement S. Duperron

Anne Mathilde Brochard, Stage Master 1 -16 mai - 11 septembre (2015), Université Catholique de l'Ouest, Structure et diversité de la faune des sites hydrothermaux actifs et inactifs: dépouillement et exploitation des données de la campagne océanographique BICOSE. Jozée Sarrazin, Lénaïck Menot.

Anne-Mathilde Brochard, Stage Master I (2015). Université Catholique d'Angers. Comparaison des communautés faunistiques associées aux assemblages de Bathymodiolus azoricus et Bathymodiolus puteoserpensis des champs hydrothermaux Menez Gwen, Lucky Strike et Snake Pit de la dorsale médio-Atlantique. Co-encadrement : Jozée Sarrazin, Lénaïck Menot.

Bruno Labelle, Stage Master II, (2015) UPMC. Etude intégrée de la structure et du fonctionnement des assemblages de gastéropodes de la dorsale médio-Atlantique. Co-encadrement : Jozée Sarrazin, Marjolaine Matabos.

Julia Machon Stage Master II (2015) Sciences de l'Univers, Environnement, Ecologie - spécialité Biologie et Bio-ressources marines) Université Pierre et Marie Curie (UPMC, Paris) Etude comparée de l'olfaction chez la crevette hydrothermale Mirocaris fortunata et la crevette côtière Palaemon elegans" Encadrement : M. Zbinden / J. Ravaux

Romain Sabroux Stage Master II (2015). Biodiversité et histoire évolutive des Pycnogonides (Arthropoda : Chelicerata : Pycnogonida). Encadrement Laure Corbari& Alexandre Hassanin, UMR 7205 ISyEB - Institut de Systématique, Evolution et Biodiversité

Sébastien Le Guellec Stage Master II (2015)- Microbiologie Fondamentale et Appliquée) UBO. Identification et caractérisation fonctionnelle de précurseurs de colonisation microbienne de sulfure-massif hydrothermal. Encadrement E. Roussel.

Camille Berthod Stage Master 1 (2014) Sciences de l'Univers, Environnement, Ecologie - spécialité Biologie et Bio-ressources marines) Université Pierre et Marie Curie (UPMC, Paris)). Adaptations sensorielles chez les crevettes des sources hydrothermales. Encadrement : M. Zbinden / J. Ravaux

Thesis using campaign data

Methou Pierre (2019). Cycles de vie de deux crevettes hydrothermales de la dorsale médio-atlantique : Rimicaris exoculata et Rimicaris chacei / Lifecycles of two hydrothermal vent shrimps from the Mid-Atlantic Ridge : Rimicaris exoculata and Rimicaris chacei : Embryonic development, larva dispersal, recruitment, reproduction & symbioses acquisition. PhD Thesis, Université de Bretagne Occidentale.


Sabroux Romain (2018). Biodiversité et histoire évolutive des Pycnogonides (Arthropoda, Pycnogonida) / Biodiversity and evolutionary history of sea spiders (Anthropoda, Pycnogonida). PhD Thesis, Museum national d'histoire naturelle - MNHN PARIS.


Lelièvre Yann (2018). Structure et dynamique temporelle des communautés hydrothermales inféodées à la dorsale Juan de Fuca : utilisation d'une approche observatoire fond de mer / Structure and temporal dynamics of hydrothermal communities from the Juan de Fuca Ridge : a seafloor observatory approach. PhD Thesis, Université de Bretagne occidentale. https://archimer.ifremer.fr/doc/00497/60907/


Elodie Leroy (2018-2021) Thèse à l'Ecole Doctorale des Sciences de la Mer (UBO) sur un financement Ifremer (100%) Thèse encadré par Erwan Roussel et Mohamed Jebbar (LM2E) ; Caractérisation des processus hydrogène-dépendant de production de formate par des micro-organismes hyperthermophiles associés aux écosystèmes hydrothermaux.

Lourdes Velo Suarez, post doctorat, 2018 Génomique de la symbiose digestive Rimicaris spp Ifremer LabexMer. Laboratoire LMEE Ifremer

Maxime Allioux. Etudiant en thèse de l'université de Bretagne Occidentale. Financement UBO LIA MicrobSEA- UBO ARED. Thèse co-dirigée par Karine ALAIN (50%), Mohamed JEBBAR (UMR6197) (50%), et Zongze SHAO (KLAMBR-TIO Xiamen). Sujet : « Physiologie et génomique de microorganismes hydrothermaux incultivés du cycle du soufre (dismutation du soufre, composés organosulfurés) ». (2018 -2021).

V. Cueff-Gauchard, thèse UBL, formation diplômante, directrice de thèse M.A. Cambon-Bonavita, 2018-2021, Fonctionnement des communautés symbiotiques chez la crevette hydrothermale Rimicaris sp. par approches in situ. 2018-2021.

Apremont Vincent (2017). Description de la diversité microbienne associée à la crevette Rimicaris Chacei : une possible double symbiose. PhD Thesis, Université de Bretagne Occidentale.


J. Réveillaud, post doctorat, 2017 Génomique comparative de la symbiose Rimicaris spp de la fosse des Caïmans à la dorsale Médio-Atlantique Ifremer LabexMer. Laboratoire LMEE Ifremer

Marc Cozannet. Thèse de l'université de Bretagne Occidentale. Financement MENRT-ARED LabexMER. Thèse co-dirigée par Karine ALAIN (65%) et Laurent Toffin (35%). Sujet : « Caractérisation métabolique, phénotypique et génomique de représentants cultivés du 7e ordre des méthanogènes». 1er Octobre 2017 -> fin prévue en octobre 2020.

Boyer Coraline (2016). De nouveaux systèmes hôtes-virus associés aux sources hydrothermales océaniques profondes. PhD Thesis, Université de Bretagne Occidentale. https://archimer.ifremer.fr/doc/00609/72129/


Le Bloa Simon (2016). Mode de reconnaissance hôte symbionte en milieux extrêmes : cas du modèle symbiotique Rimicaris exoculata / Toward a better understanding of the symbiotic relationships in Rimicaris exoculata model. PhD Thesis, Université de Bretagne occidentale. https://archimer.ifremer.fr/doc/00498/60918/


Hernandez Avila Ivan (2016). Dispersion larvaire et cycle de vie dans les environnements hydrothermaux profonds : le cas de Rimicaris exoculata et d'espèces proches / Larval dispersal and life cycle in deep-water hydrothermal vents : the case of Rimicaris exoculata and related species. PhD Thesis, Université de Bretagne occidentale. https://archimer.ifremer.fr/doc/00498/60927/


Pierre Méthou (2016-2019). Thèse à l'Ecole Doctorale des Sciences de la Mer (UBO) sur un financement Ifremer (50%) et ARED/labexMer (50%). Thèse encadré par Florence Pradillon EEP et Marie-Anne Cambon-Bonavita (HDR), LMEE. Life cycles of Two Different Rimicaris Species: Juvenile Recruitment and Acquisition of Symbiosis.

A. Perhirin, Post-doctorat (03/08/2015 - 30/09/2016) Approche intégrée modèle-données en systèmes hydrothermaux. DS Ifremer, MIDAS. Encadrants : Cécile Cathalot, Pierre-Marie Sarradin

Bérénice Piquet (2015 - 2018) Ecole Doctorale 227 UPMC / MNHN Sciences de la Nature et de l'Homme : évolution et écologie « FLEXSYBI - FLEXibilité des SYmbioses entre BIvalves et bactéries chimiotrophes : mécanismes, régulation et résilience » Encadrement : S. Duperron A. Andersen Laboratoire UPMC Paris et Roscoff

F. Chever, Post-doctorat (01/03/2015 - 31/05/2015) Approche intégrée modèle-données en systèmes hydrothermaux. DS Ifremer, MIDAS. Encadrants: Cécile Cathalot, Pierre-Marie Sarradin

Julia Machon (2015-2018) Ecole Doctorale 227 UPMC / MNHN Sciences de la Nature et de l'Homme : évolution et écologie. Adaptations sensorielles chez les crevettes hydrothermales profondes : Comparaison des facultés sensorielles de la crevette hydrothermale Mirocaris fortunata et de l'espèce côtière Palaemon elegans Encadrement : J. Ravaux / M. Zbinden, laboratoire UPMC Paris

Romain Sabroux (2015-2018) : Biodiversité et histoire évolutive des Pycnogonides (Arthropoda, Pycnogonida). Dir Hassanin A. & Corbari L. (MNHN UMR 7205), ED 227 « Sciences de la Nature et de l'Homme : évolution et écologie »

Sébastien Le Guellec. (2015-2018) Thèse à l'Ecole Doctorale des Sciences de la Mer (UBO) sur un financement Ifremer (50%) et ARED/labexMer (50%). Thèse encadré par Yves Fouquet (LGM - Ifremer) et Erwan Roussel (LM2E) au LM2E. Identification et caractérisation fonctionnelle des communautés microbiennes en interaction avec les minéralisations hydrothermales. Laboratoire LMEE et LGM Ifremer.

Perrine Mandon (2014-2017) Origine évolutive des organismes phares des milieux hydrothermaux. Encadrement Sarah Samadi UMR 7205 ISyEB - Institut de Systématique, Evolution et Biodiversité; Stéphane Hourdez UMR 7144 - Adaptation et Diversité en Milieu Marin.

Ivan Hernandez (2013-2016), Université de Bretagne Occidentale, Ecole Doctorale des sciences de la mer, Dispersion larvaire et cycles de vie en milieu profond, Encadrement : M-A. Cambon-Bonavita, F. Pradillon. Laboratoire LMEE et LEP Ifremer

S. Le Bloa, thèse EDSM en co fiancement I fremer - Région Bretagne ARED Labex Mer. 2013-2016 Mode de reconnaissance hôte-symbiontes en milieux extrêmes : cas de Rimicaris exoculata. Directeur de thèse M.A. Cambon-Bonavita (Ifremer) et responsable scientifique A. Bazire (Université de Bretagne Sud). Laboratoire LMEE Ifremer et UBS. Thèse soutenue le 15 décembre 2016 mention très honorable.