ATIMO VATAE

Name: ATIMO VATAE
Start: 2010-05-11
End: 2010-06-19
Location: Océan Indien

Type	Campagne océanographique
Navire	Antea
Propriétaire navire	IRD
Dates	11/05/2010 - 19/06/2010
Chef(s) de mission	BOUCHET Philippe , PEREZ Thierry , LE GALL Line
	LAB. BIOLOGIE DES INVERTEBRES MARINS ET MALACOLOGIE 57, Rue Cuvier 75005 PARIS +33 (0)1 40.79.31.07 doumenc@mnhn.fr https://www.mnhn.fr/fr
DOI	10.17600/10110040
Objectif	Le "Grand Sud" de Madagascar est une enclave marine tempérée remarquable au sein d'une province tropicale. Depuis le début des années 1990, les collectionneurs de coquillages ont découvert dans cette région plusieurs dizaines d'espèces nouvelles, essentiellement collectées en laisses de mer à la côte ou en sous-produit de l'activité villageoise de pêche à la langouste sur les petits fonds de 5 à 30 mètres. Ces découvertes attestent de l'originalité de la région et de son très faible niveau d'exploration. Le contexte hydroclimatique particulier laisse supposer l'existence d'une zone de fort endémisme. Ces découvertes se sont concentrées sur les côtes des régions Anosy et Androy de Madagascar, ce que les malgaches appellent le "Grand Sud", ou Atimo Vatae, d'où le nom de la campagne. La campagne de l'Antea faisait partie intégrante d'une expédition incluant trois autres volets: (i) un leg à terre basé à Fort Dauphin, succédé (ii) d'un leg à terre à Lavanono, avec un succédané de laboratoire maritime et des moyens de récolte en plongée opérant dans un rayon d'une à deux heures de la base ; (iii) un leg embarqué à bord du crevettier « Nosy Be 11 » dont l'objectif était d'explorer par chalutage le plateau continental en dessous des profondeurs plongeables. L'Antéa a donc été utilisé pour des prélèvements en plongée dans les secteurs les plus éloignés des bases à terre de Fort Dauphin et Lavanono. Les résultats attendus étaient un inventaire de la biodiversité remarquable entre 0 et 30 mètres de profondeur, la découverte d'espèces nouvelles, la caractérisation par « barcoding » de la majorité des échantillons prélevés, et la description des principales communautés benthiques et des grandes unités biogéographiques. Un partenariat local spécifique avec une grande ONG devait permettre la création d'outils de transfert de connaissances pour une meilleure conservation de la biodiversité de cette écorégion.

Contexte scientifique et programmatique des campagnes

La campagne Atimo Vatae s'inscrit dans un programme de "grandes expéditions naturalistes", intitulé "La Planète Revisitée ", qui a commencé en 2006 et dont l'objectif est l'exploration de la biodiversité négligée (invertébrés terrestres et marins, plantes, champignons). Après Santo (2006), le programme a exploré certains secteurs du Mozambique et Madagascar en 2009-2010, puis la Papouasie Nouvelle-Guinée en 2012.

La cible géographique de l'expédition Atimo Vatae (qui signifie "Grand Sud" en langue malgache) concernait la zone côtière et le plateau continental du Sud Madagascar (régions Anosy et Androy). L'expédition a impliqué au total 64 participants scientifiques de 15 pays (France, Madagascar, Mozambique, Afrique du Sud, USA, Russie, Italie, Suède, Grande-Bretagne, Allemagne, Belgique, Singapour, Taiwan, Australie, Costa Rica).

L'écorégion sud-malgache, poche d'endémisme tempéré en province tropicale, et deux de ses espèces emblématiques.

L'expédition a été conduite en partenariat local avec l'Institut d'Halieutique et des Sciences de la Mer (IH.SM) de l'université de Tuléar, et avec le programme malgache de la Wildlife Conservation Society (WCS). Elle a été soutenue financièrement par la Fondation Total, la Fondation Prince Albert II de Monaco, la Fondation Stavros Niarchos et la Fondation Richard Lounsbery.

Elle s'est déroulée entre le 27 avril et le 18 juin 2010, en 5 phases :

Zones échantillonnées par les modules à terre (en lilas), par l'Antéa (en rouge) et le Nosy Bé 11 (en orange).

(1-2) Modules 1 et 2. Deux modules, constitués de groupes de 35 et 22 personnes respectivement, ont été basés à terre successivement à Fort-Dauphin et à Lavanono. Les échantillonnages ont été effectués à marée basse, en plongée et avec de petits engins trainants opérés à la main, le tout essentiellement dans un rayon d'une heure / une heure et demi autour de nos bases. Les prélèvements ont été traités dans un laboratoire disposant des équipements de base, avec une chaine de traitement allant du tri à la loupe binoculaire, à la photo et à l'échantillonnage des tissus pour le séquençage.

Les labos mis en place à Lavanono (à gauche) et à Fort-Dauphin (à droite).

(3-4) Modules 3 et 4. Chacun de ces modules - constituant ensemble la campagne Atimo Vatae évaluée en commission Flotte - était constitué d'un groupe de 9 à 10 plongeurs qualifiés, embarqués à bord de l'Antéa. Les échantillonnages ont été plus ciblés que pour les modules basés à terre, avec moins de prélèvements en vrac, mais la zone géographique couverte était plus étendue

(5) Module 5. Ce module est constitué d'un groupe de 8 personnes embarquées à bord du Nosy-Bé 11, un crevettier commercial déployé pour nous par la Société des Pêcheries de Nosy Bé. Ce module a échantillonné par dragage et chalutage sur le plateau continental et ses accores jusqu'à 1000 mètres de profondeur.

Résultats majeurs

Le Grand Sud malgache est réputé pour ses conditions météorologiques particulièrement dures. Bien que l'expédition se soit déroulée pendant la période de l'année statistiquement la plus favorable, elle n'a pas échappé au mauvais temps. À Fort-Dauphin, la mer a été globalement agitée à très agitée, ce qui a compromis l'efficacité des observations et récoltes à vue en plongée ; malgré tout, du fait d'un trait de côte complexe, les sorties sur le terrain ont été possibles tous les jours. À Lavanono, la tempête tropicale Joël a surpris par son caractère très tardif (la région est réputée "sûre" après avril) : elle a frappé notre camp les 27 et 28/5, obligeant également l'Antéa à trouver refuge à l'abri de l'ilôt Nosy Manitsa. Elle a également causé le naufrage de plusieurs pirogues du village voisin, causant la mort de 15 pêcheurs.

Un total de 236 opérations ont été menées par les modules à terre (136 à Fort-Dauphin, 100 à Lavanono), se répartissant en 44 sites de récoltes à marée basse, 119 opérations en plongée (36 suçeuses, 18 brossages, 65 récoltes à vue), et 73 stations de dragage (dragages côtiers à partir d'un Patsa). Pour ce qui concerne les modules embarqués, 62 stations de plongées ont été réalisées à partir de l'Antéa, et 120 opérations (exactement réparties en 60 dragages et 60 chalutages) à partir du Nosy Bé 11 entre 40 et 500 mètres de profondeur, exceptionnellement jusqu'à 1000 mètres. Du fait de ces différents modules menés en parallèle, notre échantillonnage de la faune et de la flore marine du Grand Sud malgache est particulièrement complet, depuis les lagunes et le supralittoral jusqu'aux accores du plateau continental. L'ensemble de la zone que nous avions ciblée a été couverte, depuis le Banc de l'Etoile et Nosy Manitsa d'un côté, jusqu'à Manantenina de l'autre. Cependant, la mauvaise météo pendant le premier leg de l'Antéa n'aura pas permis de couvrir la côte entre le Cap Andavaka et le Cap Sainte Marie. Les résultats présentés ici sont ceux de l'expédition dans son ensemble. Les résultats propres des deux legs de l'Antéa ne sont pas séparés.

L'étude taxonomique des échantillons collectés pendant ce type de campagne s'inscrit dans le temps long (10 à 20 ans et plus). Un atelier de tri spécifiquement consacré au matériel de l'expédition Atimo Vatae s'est tenu en 2011, et la totalité des échantillons a été cette année-là rendue disponible pour les études taxonomiques et moléculaires. Moins de 4 ans après la fin de l'expédition, les résultats publiés sont donc encore éminemment fragmentaires, et les impressions à chaud en retour d'expédition tiennent lieu de bilan provisoire.

Algues

Chacun des 4 modules côtiers (modules à terre et sur l'Antéa) a livré 250 à 350 espèces d'algues, en partie les mêmes, en partie différentes d'un module à l'autre, et le total des macroalgues dépassera probablement 500 espèces pour l'ensemble de l'expédition. Les affinités avec l'Afrique du Sud / le Natal sont évidentes, avec sans doute 75% des espèces partagées avec cette région.

Mollusques

Environ 800-900 espèces ont été échantillonnées aussi bien à Fort-Dauphin qu'à Lavanono, et des différences assez considérables sont apparues entre les deux sites : de l'ordre de 40% des espèces ne sont présentes que sur un seul site, ce qui confirme aussi a posteriori que nous avons bien fait de ne pas limiter l'expédition à un seul site. Au total, le nombre d'espèces de mollusques sur la zone d'étude dépassera sans aucun doute la barre des 1500. C'est à la fois beaucoup (il y a 2030 espèces dans toute la Méditerranée) et peu (les chiffres équivalents à Panglao [Philippines] et Santo étaient de l'ordre de 4 à 6000 espèces), mais c'est sans doute pour les mollusques que l'endémisme est le plus remarquable : probablement de l'ordre de 25%.

Crustacés

Au terme de l'atelier de tri qui s'est tenu en 2011, 766 espèces de décapodes et stomatopodes ont été échantillonnés au cours de l'expédition. Là encore, une rapide comparaison permet de mettre ces chiffres en perspective : il y a 672 espèces de décapodes dans toutes les mers d'Europe - du Spitsberg aux Canaries -, et les chiffres de Panglao et Santo atteignaient 1100-1600 espèces.

Poissons

253 espèces ont été échantillonnées à Fort-Dauphin, 160 à bord de l'Antéa, et un nombre encore indéterminé à bord du Nosy Bé 11. À Fort-Dauphin, 16% des espèces échantillonnées étaient nouvelles pour la Science (4 espèces) ou nouvelles pour Madagascar (dont plusieurs espèces réputées endémiques d'Afrique du Sud), ce qui est remarquable pour un groupe aussi étudié que les poissons.

Autres groupes

Tous les autres groupes du macrobenthos ont été échantillonnés avec plus ou moins d'intensité pendant au moins 2 ou 3 des 5 modules, et nous pouvons penser que les grands spongiaires, les coraux, les octocoralliaires, les bryozoaires, les échinodermes, les ascidies ont été raisonnablement couverts ; par contre, les annélides, les hydraires, les actinies, les crustacés autres que décapodes ont sans aucun doute été insuffisamment échantillonnés.

Bilan général

Incontestablement, il reste encore d'autres découvertes à faire dans la région. L'exhaustivité de l'inventaire était difficile dans un contexte d'extrême hétérogénéité spatiale des peuplements ; par exemple, la grosse étoile de mer Tromidia (peut-être nouvelle ?) n'a été revue que sur le site exact où elle avait été aperçue lors de la mission de repérage de novembre 2008, et nulle part ailleurs ! Nous avons par ailleurs tous le sentiment que la tranche de profondeurs de 1 à 10 mètres a été très mal prospectée à cause de la houle, des déferlantes et/ou de la mauvaise visibilité même les jours de beau temps. Enfin, certains organismes - en particulier les algues et les nudibranches - ont des occurrences très saisonnières, et il est également certain qu'une autre expédition, à une autre saison, donnerait d'autres résultats.

Par rapport à l'ouest du Pacifique (Philippines, Iles Salomon, Nouvelle-Calédonie), généralement considéré comme le centre de richesse spécifique des faunes marines, cette partie de l'Océan Indien nous est apparue beaucoup moins diversifiée. Que ce soit au Mozambique ou à Madagascar, et pour un nombre comparable d'opérations, le nombre d'espèces est seulement le tiers ou la moitié de ce qu'il serait en Nouvelle-Calédonie ou aux Philippines.

En revanche, la moitié au moins des espèces échantillonnées n'étaient pas familières des scientifiques embarqués. Cela ne signifie pas automatiquement que la moitié des espèces est nouvelle pour la Science, mais cette observation souligne de manière assez inattendue le très fort régionalisme des faunes. En d'autres termes, le sud-ouest de l'océan Indien n'est pas assimilable en terme de biodiversité à d'autres régions de la province biogéographique Indo-Pacifique. Cette originalité a été reconnue lors d'un colloque qui s'est tenu en 2012 et a, sur la base des résultats préliminaires de l'expédition, retenu le Grand Sud malgache comme site potentiel du Patrimoine Mondial de l'UNESCO.

Il faut signaler, enfin, que l'expédition Atimo Vatae a été le sujet d'étude d'un groupe de chercheurs en Sciences de l'Homme qui, dans la cadre d'une ANR "Grandes expéditions", ont étudié le fonctionnement de l'expédition, les relations des chercheurs avec les populations locales, et les pratiques scientifiques dans le domaine de la taxonomie - en particulier le rôle des amateurs de haut niveau dans le renouveau de la systématiques. Certaines de leurs publications sont listées pour mémoire en fin de fiche R2.

Bibliographie

Publications

Nocella Elisa, Fassio Giulia, Zuccon Dario, Puillandre Nicolas, Modica Maria Vittoria, Oliverio Marco (2024). From coral reefs into the abyss: the evolution of corallivory in the Coralliophilinae (Neogastropoda, Muricidae). Coral Reefs, 43, 1285-1302. Publisher's official version : https://doi.org/10.1007/s00338-024-02537-1 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00904/101623/

Yang Yi, Templado José, Puillandre Nicolas, Zardoya Rafael (2024). Mitogenomic phylogeny of Nassariidae (Neogastropoda: Buccinoidea). Journal Of Molluscan Studies, 90(3), eyae020 (11p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.1093/mollus/eyae020 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00898/101027/

Paul Zaharias, Kantor Yuri I., Fedosov E. Alexander, Puillandre Nicolas (2024). Coupling DNA barcodes and exon-capture to resolve the phylogeny of Turridae (Gastropoda, Conoidea). Molecular Phylogenetics And Evolution, 191, 107969 (10p.). https://doi.org/10.1016/j.ympev.2023.107969

Russini V., Fassio G., Nocella E., Houart R., Barco A., Puillandre N., Lozouet P., Modica M. V., Oliverio M. (2023). Whelks, rock-snails, and allied: a new phylogenetic framework for the family Muricidae (Mollusca: Gastropoda). European Zoological Journal, 90(2), 856-868. Publisher's official version : https://doi.org/10.1080/24750263.2023.2283517 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00864/97639/

Lagourgue Laura, Rousseau Florence, Zubia Mayalen, Payri Claude E. (2023). Diversity of the genus Avrainvillea (Dichotomosiphonaceae, Chlorophyta): new insights and eight new species. European Journal Of Phycology, 58(4), 399-426. Publisher's official version : https://doi.org/10.1080/09670262.2023.2164907 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00822/93398/

Goulding Tricia C., Strong Ellen E., Quattrini Andrea M. (2023). Target‐capture probes for phylogenomics of the Caenogastropoda. Molecular Ecology Resources, 23(6), 1372-1388. Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/1755-0998.13793 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00831/94254/

Sabroux Romain, Corbari Laure, Hassanin Alexandre (2023). Phylogeny of sea spiders (Arthropoda: Pycnogonida) inferred from mitochondrial genome and 18S ribosomal RNA gene sequences. Molecular Phylogenetics And Evolution, 182, 107726 (21p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ympev.2023.107726 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00820/93201/

Fassio Giulia, Stefani Matteo, Russini Valeria, Buge Barbara, Bouchet Philippe, Treneman Nancy, Malaquias Manuel Antonio E., Schiaparelli Stefano, Modica Maria Vittoria, Oliverio Marco (2023). Neither slugs nor snails: a molecular reappraisal of the gastropod family Velutinidae. Zoological Journal Of The Linnean Society, 197(4), 924-964. https://doi.org/10.1093/zoolinnean/zlac091

Galea Horia R. (2023). New records, taxonomic notes, descriptions and redescriptions of some uncommon thecate hydroids (Cnidaria: Hydrozoa: Leptothecata). Revue Suisse De Zoologie, 130(1), 25-50. Publisher's official version : https://doi.org/10.35929/RSZ.0086 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00835/94688/

Houart Roland (2023). The Genus Enixotrophon (Gastropoda: Muricidae: Pagodulinae): an Update on Species from the Tropical Indo-West Pacific. Venus (Journal of the Malacological Society of Japan), 81(1-4), 26p. Publisher's official version : https://doi.org/10.18941/venus.81.1-4_1 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00843/95462/

Hun Boo Ga, Leliaert Frederik, Le Gall Line, Coppejans Eric, de Clerck Olivier, Van Nguyen Tu, Payri Claude E., Miller Kathy Ann, Yoon Hwan Su (2022). Ancient Tethyan Vicariance and Long-Distance Dispersal Drive Global Diversification and Cryptic Speciation in the Red Seaweed Pterocladiella. Frontiers In Plant Science, 13, 849476 (17p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fpls.2022.849476 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00774/88568/

Rodríguez-Flores P.C., Macpherson E., Schnabel K., Ahyong S.T., Corbari L., Machordom A. (2022). Depth as a driver of evolution and diversification of ancient squat lobsters (Decapoda, Galatheoidea, Phylladiorhynchus). Molecular Phylogenetics And Evolution, 171, 107467 (19p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ympev.2022.107467 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00762/87393/

Lagourgue Laura, Leliaert Frederik, Payri Claude E. (2022). Historical biogeographical analysis of the Udoteaceae (Bryopsidales, Chlorophyta) elucidates origins of high species diversity in the Central Indo-Pacific, Western Indian Ocean and Greater Caribbean regions. Molecular Phylogenetics And Evolution, 169, 107412 (12p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ympev.2022.107412 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00745/85665/

Lagourgue Laura, Payri Claude E. (2022). Large scale diversity reassessment, evolutionary history, and taxonomic revision of the green macroalgae family Udoteaceae (Bryopsidales, Chlorophyta). Journal Of Systematics And Evolution, 60(1), 101-127. Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/jse.12716 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00665/77719/

Vereshchaka Alexander, Kulagin Dmitry, Lunina Anastasia (2021). A New Shrimp Genus (Crustacea: Decapoda) from the Deep Atlantic and an Unusual Cleaning Mechanism of Pelagic Decapods. Diversity-basel, 13(11), 536 (14p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.3390/d13110536 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00732/84396/

Lunina Anastasiia A., Kulagin Dmitry N., Vereshchaka Alexander L. (2021). Phylogenetic revision of the shrimp genera Ephyrina, Meningodora and Notostomus (Acanthephyridae: Caridea). Zoological Journal Of The Linnean Society, 193(3), 1002-1019. https://doi.org/10.1093/zoolinnean/zlaa161

Vieira Christophe, Rasoamanendrika Faravavy A., Zubia Mayalen, Bolton John J., Anderson Robert J., Engelen Aschwin H., D'Hondt Sofie, Leliaert Frederik, Payri Claude, Kawai Hiroshi, de Clerck Olivier (2021). Lobophora (Dictyotales, Phaeophyceae) from the western Indian Ocean: diversity and biogeography. South African Journal Of Botany, 142, 230-246. Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.sajb.2021.06.015 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00705/81734/

Hanafi-Portier Melissa, Samadi Sarah, Corbari Laure, Chan Tin-Yam, Chen Wei-Jen, Chen Jhen-Nien, Lee Mao-Ying, Mah Christopher, Saucède Thomas, Borremans Catherine , Olu Karine (2021). When Imagery and Physical Sampling Work Together: Toward an Integrative Methodology of Deep-Sea Image-Based Megafauna Identification. Frontiers in Marine Science, 8, 749078 (25p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmars.2021.749078 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00735/84656/

Rodriguez-Flores Paula C., Macpherson Enrique, Machordom Annie (2021). Revision of the squat lobsters of the genus Phylladiorhynchus Baba, 1969 (Crustacea, Decapoda, Galatheidae) with the description of 41 new species. Zootaxa, 5008(1), 1-159. https://doi.org/10.11646/zootaxa.5008.1.1

Hallan Anders, Criscione Francesco, Fedosov Alexander, Puillandre Nicolas (2021). Few and far apart: integrative taxonomy of Australian species of Gladiobela and Pagodibela (Conoidea : Raphitomidae) reveals patterns of wide distributions and low abundance. Invertebrate Systematics, 35(2), 181-202. Publisher's official version : https://doi.org/10.1071/IS20017 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00688/79986/

Fraussen Koen, Galindo Lee Ann, Rosado Jose (2020). Deep-water Photinae (Gastropoda: Nassariidae) from eastern Africa, with descriptions of five new species. European Journal Of Taxonomy, 720, 144-169. Publisher's official version : https://doi.org/10.5852/ejt.2020.720.1123 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00688/79987/

Zaharias Paul, Kantor Yuri, I, Fedosov Alexander E., Criscione Francesco, Hallan Anders, Kano Yasunori, Bardin Jeremie, Puillandre Nicolas (2020). Just the once will not hurt: DNA suggests species lumping over two oceans in deep-sea snails (Cryptogemma). Zoological Journal of the Linnean Society, 190(2), 532-557. Publisher's official version : https://doi.org/10.1093/zoolinnean/zlaa010 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00688/79988/

Fedosov A. E., Puillandre N. (2020). Integrative taxonomy of the Clavus canalicularis species complex (Drilliidae, Conoidea, Gastropoda) with description of four new species. Molluscan Research, 40(3), 251-266. https://doi.org/10.1080/13235818.2020.1788695

Kantor Yuri I, Puillandre Nicolas, Bouchet Philippe (2020). The challenge of integrative taxonomy of rare, deep-water gastropods: the genus Exilia (Neogastropoda: Turbinelloidea: Ptychatractidae). Journal Of Molluscan Studies, 86(2), 120-138. https://doi.org/10.1093/mollus/eyz037

Modica Maria Vittoria, Gorson Juliette, Fedosov Alexander E., Malcolm Gavin, Terryn Yves, Puillandre Nicolas, Holford Mande (2020). Macroevolutionary Analyses Suggest That Environmental Factors, Not Venom Apparatus, Play Key Role in Terebridae Marine Snail Diversification. Systematic Biology, 69(3), 413-430. Publisher's official version : https://doi.org/10.1093/sysbio/syz059 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00760/87172/

Fedosov Alexander E., Malcolm Gavin, Terryn Yves, Gorson Juliette, Modica Maria Vittoria, Holford Mande, Puillandre Nicolas (2019). Phylogenetic classification of the family Terebridae (Neogastropoda: Conoidea). Journal Of Molluscan Studies, 85, 359-387. Publisher's official version : https://doi.org/10.1093/mollus/eyz004 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00620/73228/

Fedosov Alexander E., Gutierrez Manuel Caballer, Buge Barbara, Sorokin Pavel, V, Puillandre Nicolas, Bouchet Philippe (2019). Mapping the missing branch on the neogastropod tree of life: molecular phylogeny of marginelliform gastropods. Journal Of Molluscan Studies, 85(4), 440-452. Publisher's official version : https://doi.org/10.1093/mollus/eyz028 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00620/73229/

Phuong Mark A., Alfaro Michael E., Mahardika Gusti N., Marwoto Ristiyanti M., Prabowo Romanus Edy, von Rintelen Thomas, Vogt Philipp W. H., Hendricks Jonathan R., Puillandre Nicolas (2019). Lack of Signal for the Impact of Conotoxin Gene Diversity on Speciation Rates in Cone Snails. Systematic Biology, 68(5), 781-796. Publisher's official version : https://doi.org/10.1093/sysbio/syz016 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00760/87177/

Cunha Tauana Junqueira, Lemer Sarah, Bouchet Philippe, Kano Yasunori, Giribet Gonzalo (2019). Putting keyhole limpets on the map: phylogeny and biogeography of the globally distributed marine family Fissurellidae (Vetigastropoda, Mollusca). Molecular Phylogenetics And Evolution, 135, 249-269. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2019.02.008

Uribe Juan E., Irisarri Iker, Templado José, Zardoya Rafael (2019). New patellogastropod mitogenomes help counteracting long-branch attraction in the deep phylogeny of gastropod mollusks. Molecular Phylogenetics And Evolution, 133, 12-23. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2018.12.019

Fassio Giulia, Modica Maria Vittoria, Alvaro Maria Chiara, Buge Barbara, Salvi Daniele, Oliverio Marco, Schiaparelli Stefano (2019). An Antarctic flock under the Thorson's rule: Diversity and larval development of Antarctic Velutinidae (Mollusca: Gastropoda). Molecular Phylogenetics And Evolution, 132, 1-13. Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ympev.2018.11.017 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00760/87179/

Strong Ellen, Puillandre Nicolas, Beu Alan, Castelin Magalie, Bouchet Philippe (2019). Frogs and tuns and tritons - A molecular phylogeny and revised family classification of the predatory gastropod superfamily Tonnoidea (Caenogastropoda). Molecular Phylogenetics And Evolution, 130, 18-34. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2018.09.016

Houart Roland, Heros Virginie, Zuccon Dario (2019). Description of Two New Species of Dermomurex (Gastropoda: Muricidae) with a Review of Dermomurex (Takia) in the Indo-West Pacific. Venus (Journal of the Malacological Society of Japan), 78(1-2), 1-25. Publisher's official version : https://doi.org/10.18941/venus.78.1-2_1 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00609/72113/

Mah Christopher L. (2018). New genera, species and occurrence records of Goniasteridae (Asteroidea; Echinodermata) from the Indian Ocean. Zootaxa, 4539(1), 1-116. https://doi.org/10.11646/zootaxa.4539.1.1

Abdelkrim Jawad, Aznar-Cormano Laetitia, Fedosov Alexander E., Kantor Yuri I., Lozouet Pierre, Phuong Mark A., Zaharias Paul, Puillandre Nicolas (2018). Exon-Capture-Based Phylogeny and Diversification of the Venomous Gastropods (Neogastropoda, Conoidea). Molecular Biology And Evolution, 35(10), 2355-2374. Publisher's official version : https://doi.org/10.1093/molbev/msy144 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00760/87180/

Fedosov Alexander, Puillandre Nicolas, Herrmann Manfred, Kantor Yuri, Oliverio Marco, Dgebuadze Polina, Modica Maria Vittoria, Bouchet Philippe (2018). The collapse of Mitra: molecular systematics and morphology of the Mitridae (Gastropoda: Neogastropoda). Zoological Journal Of The Linnean Society, 183(2), 253-337. https://doi.org/10.1093/zoolinnean/zlx073

Taylor John D., Glover Emily A. (2018). Hanging on — lucinid bivalve survivors from the Paleocene and Eocene in the western Indian Ocean (Bivalvia: Lucinidae). Zoosystema, 40(2), 123-142. Publisher's official version : https://doi.org/10.5252/zoosystema2018v40a7 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00445/55655/

Kantor Yuri I., Fedosov Alexander E., Snyder Martin Avery, Bouchet Philippe (2018). Pseudolatirus Bellardi, 1884 revisited, with the description of two new genera and five new species (Neogastropoda: Fasciolariidae). European Journal Of Taxonomy, 433, 1-57. Publisher's official version : https://doi.org/10.5852/ejt.2018.433 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00620/73240/

Kantor Yu. I., Fedosov A. E., Puillandre N., Bonillo C., Bouchet P. (2017). Returning to the roots: morphology, molecular phylogeny and classification of the Olivoidea (Gastropoda: Neogastropoda). Zoological Journal Of The Linnean Society, 180(3), 493-541. Publisher's official version : https://doi.org/10.1093/zoolinnean/zlw003 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00386/49713/

Chan Benny Kwok Kan, Corbari Laure, Moreno Paula A. Rodriguez, Tsang Ling Ming (2017). Molecular phylogeny of the lower acorn barnacle families (Bathylasmatidae, Chionelasmatidae, Pachylasmatidae and Waikalasmatidae) (Cirripedia: Balanomorpha) with evidence for revisions in family classification. Zoological Journal Of The Linnean Society, 180(3), 542-555. https://doi.org/10.1093/zoolinnean/zlw005

Puillandre Nicolas, Tenorio Manuel J. (2017). A question of rank: DNA sequences and radula characters reveal a new genus of cone snails (Gastropoda: Conidae). Journal Of Molluscan Studies, 83(2), 200-210. Publisher's official version : https://doi.org/10.1093/mollus/eyx011 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00476/58802/

Galindo Lee Ann, Kool Hugo H., Dekker Henk (2017). Review of the Nassarius pauperus (Gould, 1850) complex (Nassariidae): Part 3, reinstatement of the genus Reticunassa, with the description of six new species. European Journal Of Taxonomy, 275, 1-43. Publisher's official version : https://doi.org/10.5852/ejt.2017.275 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00476/58803/

Uribe Juan E., Puillandre Nicolas, Zardoya Rafael (2017). Beyond Conus: Phylogenetic relationships of Conidae based on complete mitochondrial genomes. Molecular Phylogenetics And Evolution, 107, 142-151. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2016.10.008

Sabroux Romain, Corbari Laure, Krapp Franz, Bonillo Celine, Le Prieur Stepahnie, Hassanin Alexandre (2017). Biodiversity and phylogeny of Ammotheidae (Arthropoda: Pycnogonida). European Journal Of Taxonomy, 286, 1-33. Publisher's official version : https://doi.org/10.5852/ejt.2017.286 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00484/59530/

Taylor John D., Glover Emily A., Smith Lisa, Ikebe Chiho, Williams Suzanne T. (2016). New molecular phylogeny of Lucinidae: increased taxon base with focus on tropical Western Atlantic species (Mollusca: Bivalvia). Zootaxa, 4196(3), 381-398. https://doi.org/10.11646/zootaxa.4196.3.2

Rosler Anja, Perfectti Francisco, Pena Viviana, Carlos Braga Juan (2016). Phylogenetic relationships of corallinaceae (Corallinales, Rhodophyta): taxonomic implications for reef-building corallines. Journal Of Phycology, 52(3), 412-431. https://doi.org/10.1111/jpy.12404

Galindo Lee Ann, Puillandre Nicolas, Utge Jose, Lozouet Pierre, Bouchet Philippe (2016). The phylogeny and systematics of the Nassariidae revisited (Gastropoda, Buccinoidea). Molecular Phylogenetics And Evolution, 99, 337-353. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2016.03.019

Bitner Maria Aleksandra, Logan Alan (2016). Recent Brachiopoda from the Mozambique-Madagascar area, western Indian Ocean. Zoosystema, 38(1), 5-41. https://doi.org/10.5252/z2016n1a1

Fedosov Alexander, Puillandre Nicolas, Kantor Yuri, Bouchet Philippe (2015). Phylogeny and systematics of mitriform gastropods (Mollusca: Gastropoda: Neogastropoda). Zoological Journal Of The Linnean Society, 175(2), 336-359. Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/zoj.12278 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00476/58810/

Boo Ga Hun, Le Gall Line, Rousseau Florence, de Reviers Bruno, Coppejans Eric, Anderson Robert, Boo Sung Min (2015). Phylogenetic relationships of Gelidiella (Gelidiales, Rhodophyta) from Madagascar with a description of Gelidiella incrassata sp nov. Cryptogamie Algologie, 36(2), 219-237. https://doi.org/10.7872/crya.v36.iss2.2015.219

Manghisi Antonio, Morabito Marina, Boo Ga Hun, Boo Sung Min, Bonillo Celine, de Clerck Olivier, Le Gall Line (2015). Two novel species of Yonagunia (Halymeniales, Rhodophyta) were uncovered in the South of Madagascar during the Atimo-Vatae Expedition. Cryptogamie Algologie, 36(2), 199-217. https://doi.org/10.7872/crya.v36.iss2.2015.199

Le Gall Line, Pena Viviana, Gey Delphine, Manghisi Antonio, Dennetiere Bruno, de Reviers Bruno, Rousseau Florence (2015). A new species of Stenogramma was uncovered Indian Ocean during the expedition Atimo Vatae: Stenogramma lamyi sp nov. Cryptogamie Algologie, 36(2), 189-198. https://doi.org/10.7872/crya.v36.iss2.2015.189

Mattio Lydiane, Bolton John J., Anderson Robert J. (2015). Contribution to the revision of the genus Sargassum (Fucales, Phaeophyceae) in Madagascar using morphological and molecular data. Cryptogamie Algologie, 36(2), 143-169. https://doi.org/10.7872/crya.v36.iss2.2015.143

Verbruggen Heroen, Costa Joana F. (2015). Molecular survey of Codium species diversity in southern Madagascar. Cryptogamie Algologie, 36(2), 171-187. https://doi.org/10.7872/crya.v36.iss2.2015.171

Steen Frederique, Vieira Christophe, Leliaert Frederik, Payri E. Claude, de Clerck Olivier (2015). Biogeographic affinities of Dictyotales from Madagascar: a phylogenetic approach. Cryptogamie Algologie, 36(2), 129-141. https://doi.org/10.7872/crya.v36.iss2.2015.129

Puillandre Nicolas, Stoecklin Reto, Favreau Philippe, Bianchi Estelle, Perret Frederic, Rivasseau Audrey, Limpalaer Loic, Monnier Eric, Bouchet Philippe (2014). When everything converges: Integrative taxonomy with shell, DNA and venomic data reveals Conus conco, a new species of cone snails (Gastropoda: Conoidea). Molecular Phylogenetics And Evolution, 80, 186-192. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2014.06.024

Puillandre N., Bouchet P., Duda T. F., Jr., Kauferstein S., Kohn A. J., Olivera B. M., Watkins M., Meyer C. (2014). Molecular phylogeny and evolution of the cone snails (Gastropoda, Conoidea). Molecular Phylogenetics And Evolution, 78, 290-303. Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ympev.2014.05.023 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00468/57920/

Galindo L. A., Puillandre Nicolas, Strong Ellen E., Bouchet Philippe (2014). Using microwaves to prepare gastropods for DNA barcoding. Molecular Ecology Resources, 14(4), 700-705. https://doi.org/10.1111/1755-0998.12231

Taylor John D., Glover Emily A., Williams Suzanne T. (2014). Diversification of chemosymbiotic bivalves: origins and relationships of deeper water Lucinidae. Biological Journal Of The Linnean Society, 111(2), 401-420. Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/bij.12208 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00218/32953/

Kantor Yuri, Lozouet Pierre, Puillandre Nicolas, Bouchet Philippe (2014). Lost and found: The Eocene family Pyramimitridae (Neogastropoda) discovered in the Recent fauna of the Indo-Pacific. Zootaxa, 3754(3), 239-276. https://doi.org/10.11646/zootaxa.3754.3.2

Holleman Wouter, Connell Allan D., Carpenter Kent E. (2013). Caesio xanthalytos, a new species of fusilier (Perciformes: Caesionidae) from the Western Indian Ocean, with records of range extensions for several species of Caesionidae. Zootaxa, 3702(3), 262-272. https://doi.org/10.11646/zootaxa.3702.3.4

Garcia-Varela Martin, Perez-Ponce De Leon Gerardo, Aznar Francisco J., Nadler Steven A. (2013). Phylogenetic relationship among genera of Polymorphidae (Acanthocephala), inferred from nuclear and mitochondrial gene sequences. Molecular Phylogenetics And Evolution, 68(2), 176-184. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2013.03.029

Kou Qi, Li Xinzheng, Chan Tin-Yam, Chu Ka Hou, Huang Hui, Gan Zhibin (2013). Phylogenetic relationships among genera of the Periclimenes complex (Crustacea: Decapoda: Pontoniinae) based on mitochondrial and nuclear DNA. Molecular Phylogenetics And Evolution, 68(1), 14-22. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2013.03.010

Puckridge Melody, Andreakis Nikos, Appleyard Sharon A., Ward Robert D. (2013). Cryptic diversity in flathead fishes (Scorpaeniformes: Platycephalidae) across the Indo-West Pacific uncovered by DNA barcoding. Molecular Ecology Resources, 13(1), 32-42. https://doi.org/10.1111/1755-0998.12022

Kaga Tatsuya, Heemstra Elaine (2013). First record of a rare sand whiting, Sillago caudicula (Perciformes: Sillaginidae), from Madagascar. Marine Biology Research, 9(3), 332-336. https://doi.org/10.1080/17451000.2012.742547

Houart Roland, Heros Virginie (2013). Description of new Muricidae (Mollusca: Gastropoda) collected during the ATIMO VATAE expedition to Madagascar "Deep South". Zoosystema, 35(4), 503-523. Publisher's official version : https://doi.org/10.5252/z2013n4a5 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00218/32969/

Tsang Ling Ming, Achituv Yair, Chu Ka Hou, Chan Benny Kwok Kan (2012). Zoogeography of Intertidal Communities in the West Indian Ocean as Determined by Ocean Circulation Systems: Patterns from the Tetraclita Barnacles. Plos One, 7(9), e45120. Publisher's official version : https://doi.org/10.1371/journal.pone.0045120 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00218/32975/

Castelin M., Puillandre Nicolas, Kantor Yu. I., Modica M. V., Terryn Y., Cruaud C., Bouchet P., Holford M. (2012). Macroevolution of venom apparatus innovations in auger snails (Gastropoda; Conoidea; Terebridae). Molecular Phylogenetics And Evolution, 64(1), 21-44. Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ympev.2012.03.001 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00140/25117/

Fedosov Alexander E., Puillandre Nicolas (2012). Phylogeny and taxonomy of the Kermia–Pseudodaphnella (Mollusca: Gastropoda: Raphitomidae) genus complex: a remarkable radiation via diversification of larval development. Systematics And Biodiversity, 10(4), 447-477. https://doi.org/10.1080/14772000.2012.753137

Références des publications parues dans d'autres revues ou des ouvrages scientifiques faisant référence dans la discipline

Houart Roland, Zuccon Dario, Puillandre Nicolas (2019). Description of new genera and new species of Ergalataxinae (Gastropoda: Muricidae). Novapex, 20(HS12), 1-52.

Monnier Eric, Tenorio Manuel J., Bouchet Philippe, Puillandre Nicolas (2018). The cones (Gastropoda) from Madagascar “Deep South”: composition, endemism and new taxa. XENOPHORA TAXONOMY, (19), 24-75.

Rubio Federico, Rolan Emilio (2017). New species of Crosseolidae Hickman, 2013 (Gastropoda) from the Tropical Indo-Pacific. Novapex, 18(1-2), 17-34. Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00878/98955/

OKANISHI M. & FUJITA T. 2014, A taxonomic review of the genus Asterostegus (Echinodermata: Ophiuroidea), with the description of a new species. European Journal of Taxonomy 76: 1?18.

CASTRO P., 2013. Brachyuran crabs (Crustacea, Brachyura: Crossotonotidae, Ethusidae, Euryplacidae, Goneplacidae, Latreilliidae, Palicidae, Tetraliidae, Trapeziidae), of the MAINBAZA, MIRIKI, and ATIMO VATAE expeditions to the Mozambique Channel and Madagascar. In: S. Ahyong et al. (eds), Tropical Deep?Sea Benthos 27. Mémoires du Muséum National d'Histoire Naturelle, 204: 437?466.

HOUART R., 2013. Revised classification of a group of small species of Cytharomorula Kuroda, 1953 (Muricidae: Ergalataxinae) from the Indo?West Pacific. Novapex 14(2): 25?34.

TER POORTEN J., 2013. ? Revision of the Recent species of the genus Nemocardium Meek, 1876 (Bivalvia, Cardiidae), with the descriptions of three new species. Basteria 77(4?6): 45?73.

Herbert D. G. (2012). A revision of the Chilodontidae (Gastropoda: Vetigastropoda: Seguenzioidea) of southern Africa and the south-western Indian Ocean. African Invertebrates, 53(2), 381-502.

Monniot Francoise (2012). Some ascidians from the southern coast of Madagascar collected during the "AtimoVatae" survey. Zootaxa, (3197), 1-42.

Références des articles parus dans des revues ou des journaux à grand public

20 Minutes, 28/06/2010

AFP Mondial, 25/06/2010

CNN, 29/07/2010

Europe 1 - La question environnement du jour, 1/04/2010

France 2 - JT 20H, 2 diffusion en juilet 2010

France 2 - Télématin, 02/08/2010

France Culture - Continent Sciences, 12/07/2010

France Culture - La Marche des Sciences, 27/06/2010

France Info - Les Aventuriers, 3/07/2010

France Inter - La tête au carré, 18/05/2010

France Ô - Info Afrique, 17/06/2010

France Ô - Journal de Mayotte, 16/06/2010

France Ô - Zoom Afrique, 28/06/2010

L'Express de Madagascar, 29/06/2010

LCI - Bougez Vert, 15/01/2010

La Croix Sciences & éthique, 29/06/2010

Le Figaro Magazine, 22/05/2010

Le Journal de L'Aveyron, 2/01/2010

Le Journal de Saône et Loire, 3/01/2010

Le Journal de l?Ile de la Réunion , 22/07/2010

Le Journal du CNRS, 1/02/2010

Les Echos, 16/07/2010

Madagascar Matin, 20/05/2010

National Géographic, 1/01/2010

Nous Deux, 1/02/2010

Océan Indien Magazine , 1/04/2010

Ouest France, 26/06/2010

Panda Magazine, 1/03/2010

Pèlerin, 11/03/2010

RFI - C'est pas du vent, 10/05/2010

RFI - Journaux Antenne Afrique, 11/07/2010

RFI - Microméga, 25/06/2010

RTL - C'est notre Planète, 23/06/2010

Radio Classique - Journal de 8h00, 27/06/2010

Rustica, 6/01/2010

Sciences & Vie - Hors-Série, 1/03/2010

Sciences et Avenir, 1/06/2010

TV5 Monde - Le Journal d'Afrique, 17/06/2010

TV5 Monde - Le Journal, 17/06/2010

Ushuaïa, 1/01/2010

Wapiti, 1/01/2010

AFP Économique, 27/10/2009

Direct Matin Plus, 29/10/2009

Environnement Magazine, 1/11/2009

France 24 - Sur le net, 11/12/2009

France Info - Info sciences, 27/10/2009

France Info - L'environnement, 7/11/2009

France Inter - CO2 mon amour, 7/11/2009

France Inter - Inter treize, 27/10/2009

L'Ardennais, 1/11/2009

L'Echo Républicain, 22/11/2009

L'Union, 1/11/2009

L'Yonne Républicaine, 27/10/2009

La Croix , 27/10/2009

Le Bien Public Les Dépêches, 28/10/2009

Le Courrier de la Nature, 1/05/2009

Le Journal de L'Ile de la Réunion, 21/10/2009

Le Monde, 24/10/2009

Le Point, 5/11/2009

RFI - Le quotidien de la mer, 1/12/2009

RFI - Reportage, 1/11/2009

Science & Vie, 1/12/2009

Science et Avenir, 1/12/2009

TMC - Monacoscope, 7/11/2009

Terre Sauvage, 1/11/2009

Valeurs Vertes, 1/12/2009

Références des communications dans des colloques internationaux

Obura, D.O., Church, J.E. and Gabrié, C. (2012). Assessing Marine World Heritage from an Ecosystem Perspective: The Western Indian Ocean. World Heritage Centre, United Nations Education, Science and Cultural Organization (UNESCO). 124 pp.

Références des nouvelles espèces (animales, végétales, microorganismes) décrites, lieux où sont déposés les holotypes

Asterostegus sabineae Okanishi & Fujita, 2014

Hortia solitaria Kantor, Lozouet, Puillandre & Bouchet, 2014

Caesio xanthalytos Holleman, Connel & Carpenter, 2013

Chicoreus kantori Houart & Héros, 2013

Dermomurex charlesi Houart & Héros, 2013

Ethusa pintada Castro, 2013

Favartia fournierae Houart & Héros, 2013

Favartia tantelyi Houart & Héros, 2013

Naquetia manwaii Houart & Héros, 2013

Nemocardium fulvum ter Poorten, 2013

Semiricinula bozzettii Houart & Héros, 2013

Monniotus spica Monniot, 2012

Aplidium boucheti Monniot, 2012

Aplidium hestia Monniot, 2012

Aplidium minithorax Monniot, 2012

Eudistoma pustulosum Monniot, 2012

Polycitorella graphicum Monniot, 2012

Polyclinum pedicellatum Monniot, 2012

Polyclinum tingens Monniot, 2012

Pseudodaphnella nympha Fedosov & Puillandre, 2012

Pseudodaphnella sudafricana Fedosov & Puillandre, 2012

Vaceuchelus jayorum Herbert, 2012